RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622166.1

IGHV3-54-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable 3-54 (pseudogene), humanhuman

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Gene IGHV3-54, Length 353 nt, Biotype IG V pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV3-54-201ENST00000622166 PRSS27Q9BQR3 290 aa8.97□□□□□ -0.97
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IGHV3-54-201ENST00000622166 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
IGHV3-54-201ENST00000622166 DZANK1Q9NVP4 752 aa8.97□□□□□ -0.97
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IGHV3-54-201ENST00000622166 TRILQ7L0X0 811 aa8.96□□□□□ -0.98
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IGHV3-54-201ENST00000622166 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SIMC1Q8NDZ2 872 aa8.96□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 DUSP18Q8NEJ0 188 aa8.96□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM255BQ8WV15 326 aa8.96□□□□□ -0.98
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC22A18Q96BI1 424 aa8.96□□□□□ -0.98
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IGHV3-54-201ENST00000622166 MMP28Q9H239 520 aa8.96□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 UBQLN3Q9H347 655 aa8.96□□□□□ -0.98
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IGHV3-54-201ENST00000622166 FGF22Q9HCT0 170 aa8.96□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 INPP5EQ9NRR6 644 aa8.96□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.96□□□□□ -0.98
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SATB2Q9UPW6 733 aa8.96□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 TMEM5Q9Y2B1 443 aa8.96□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 WDR45Q9Y484 360 aa8.96□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 CEP350Q5VT06 3117 aa8.96□□□□□ -0.98
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IGHV3-54-201ENST00000622166 PRSS38A1L453 326 aa8.95□□□□□ -0.98
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IGHV3-54-201ENST00000622166 SGK494L7N484 410 aa8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 GTPBP1O00178 669 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 BTN3A3O00478 584 aa8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 RNF13O43567 381 aa8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 B3GALT2O43825 422 aa8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 SLC2A10O95528 541 aa8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 CH25HO95992 272 aa8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 AK1P00568 194 aa8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 GUSBP08236 651 aa8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 ZGLP1P0C6A0 271 aa8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 CPMP14384 443 aa8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 APEX1P27695 318 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 SHC2P98077 582 aa8.95□□□□□ -0.98
IGHV3-54-201ENST00000622166 HOXC5Q00444 222 aa8.95□□□□□ -0.98
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