RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000607882.5

RABGEF1-209, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 2,654 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC6A19Q695T7 634 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 NDUFAF7Q7L592 441 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 NATD1Q8N6N6 113 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF565Q8N9K5 539 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ELOVL6Q9H5J4 265 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ARMC7Q9H6L4 198 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CRLF2Q9HC73 371 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SLAMF7Q9NQ25 335 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 KLHL1Q9NR64 748 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 C14orf105Q9NVL8 296 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC25A37Q9NYZ2 338 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJB9Q9UBS3 223 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ICE1Q9Y2F5 2266 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PTGES3LE9PB15 166 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ONECUT2O95948 504 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 KLK1P06870 262 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF12P17014 697 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 GSTM2P28161 218 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 RAC1P63000 192 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 RELQ04864 619 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 AQP6Q13520 282 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SF3B4Q15427 424 aaKnown RBP eCLIP11.63□□□□□ -0.551e-9■□□□□ 9.1
RABGEF1-209ENST00000607882 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 MSRB3Q8IXL7 192 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF555Q8NEP9 628 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SELENOMQ8WWX9 145 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC115Q96NT0 180 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ZBTB18Q99592 522 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CCDC90BQ9GZT6 254 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 RAD21L1Q9H4I0 556 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 EHD1Q9H4M9 534 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM45AQ9NWC5 275 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 DAPP1Q9UN19 280 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 MED12Q93074 2177 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ELOVL7A1L3X0 281 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 URADA6NGE7 173 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 NOTOA8MTQ0 251 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CXCR6O00574 342 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CLPXO76031 633 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 HPRP00739 348 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM11P17152 192 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SPCS2Q15005 226 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CDKL4Q5MAI5 379 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM179BQ7Z7N9 219 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 LAS2Q8IYD9 372 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 LIX1Q8N485 282 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 Q8NA96 180 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR20Q8TBZ3 569 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PPP3R2Q96LZ3 170 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 AGAP4Q96P64 663 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 QRFPRQ96P65 431 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 FUNDC2Q9BWH2 189 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 EBPLQ9BY08 206 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 DPY30Q9C005 99 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 TGIF2Q9GZN2 237 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 GORASP2Q9H8Y8 452 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SLC6A13Q9NSD5 602 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SELENONQ9NZV5 590 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CCL27Q9Y4X3 112 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 FUOMA2VDF0 154 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PGRP06401 933 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PMP22Q01453 160 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ITGADQ13349 1161 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 DPY19L1Q2PZI1 675 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ADPRMQ3LIE5 342 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 DEPDC1Q5TB30 811 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 FRG2Q64ET8 278 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 C10orf111Q8N326 155 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 WDR34Q96EX3 536 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ITCHQ96J02 903 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 KCNC2Q96PR1 638 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 FRG2BQ96QU4 278 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 BAG5Q9UL15 447 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 DNAJC13O75165 2243 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 PGRMC2O15173 223 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 FGF17O60258 216 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 ZNF3P17036 446 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 CPN2P22792 545 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 S100A1P23297 94 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 SIGIRRQ6IA17 410 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 OR4C11Q6IEV9 310 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 LAIR2Q6ISS4 152 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGEF1-209ENST00000607882 TMEM205Q6UW68 189 aa11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.9 ms