RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568875.1

SNAPC5-208, Transcript of small nuclear RNA activating complex polypeptide 5, human

TSL 2

Gene SNAPC5, Length 1,741 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZNF385B	Q569K4	471 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	DCAF10	Q5QP82	559 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	TMCO5A	Q8N6Q1	288 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	AMER3	Q8N944	861 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	FDCSP	Q8NFU4	85 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	OR10G2	Q8NGC3	310 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	RNF217	Q8TC41	542 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	LGALS12	Q96DT0	336 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	FER1L6-AS2	Q96M78	137 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	FEV	Q99581	238 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	SLC35A5	Q9BS91	424 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	RNF6	Q9Y252	685 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	SH3GLB1	Q9Y371	365 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		10.79	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	FUOM	A2VDF0	154 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	CLCA1	A8K7I4	914 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875		J3QKU1	62 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875		J3QRK9	145 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	PEX12	O00623	359 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	MPZL2	O60487	215 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	NADK	O95544	446 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	IGHE	P01854	428 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	CDK1	P06493	297 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	ALOX5	P09917	674 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	ARAF	P10398	606 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	POR	P16435	677 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	EPHA2	P29317	976 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	IDUA	P35475	653 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	BCL6	P41182	706 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	LIMS1	P48059	325 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	CCR8	P51685	355 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	SOX8	P57073	446 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	CDK6	Q00534	326 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	ITGAD	Q13349	1161 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	DSG2	Q14126	1118 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	VWA2	Q5GFL6	755 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	KIRREL2	Q6UWL6	708 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	PRICKLE2	Q7Z3G6	844 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	GALNT10	Q86SR1	603 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	EGFL6	Q8IUX8	553 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	KRT78	Q8N1N4	520 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	MAPKAP1	Q9BPZ7	522 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	COPS4	Q9BT78	406 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	RHBG	Q9H310	441 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	CHCHD3	Q9NX63	227 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	OSGIN1	Q9UJX0	560 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	ANGPT4	Q9Y264	503 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZNF451	Q9Y4E5	1061 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	FLNC	Q14315	2725 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875		A0A1W2PRB8	838 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	SH3D21	A4FU49	640 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875		A6NL46	340 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	SOCS6	O14544	535 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	FADS2	O95864	444 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	C6orf47	O95873	294 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	STATH	P02808	62 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	TFPT	P0C1Z6	253 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	ETFA	P13804	333 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	CD36	P16671	472 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	RHCE	P18577	417 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	UQCRC2	P22695	453 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	CXCR2	P25025	360 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	TGFBR2	P37173	567 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	XCR1	P46094	333 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	OLR1	P78380	273 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	KLRB1	Q12918	225 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	NDUFA9	Q16795	377 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	TMIGD1	Q6UXZ0	262 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	ADCK1	Q86TW2	530 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	SLC5A8	Q8N695	610 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	KCT2	Q8NC54	265 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	MAL2	Q969L2	176 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	TAMM41	Q96BW9	452 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	PIP5K1A	Q99755	562 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	NUDT9	Q9BW91	350 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		10.78	□□□□□ -0.68
SNAPC5-208	ENST00000568875	MMP27	Q9H306	513 aa		10.78	□□□□□ -0.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms