RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560576.1

TMOD2-204, Transcript of tropomodulin 2, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD2, Length 2,348 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2-204ENST00000560576 C2orf80Q0P641 193 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 TMEM44Q2T9K0 475 aa6.75□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.75□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 FBXW5Q969U6 566 aa6.75□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.75□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 CCDC151A5D8V7 595 aa6.74□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 PRR5P85299 388 aa6.74□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 TRADDQ15628 312 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP6.74□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 TMEM107Q6UX40 140 aa6.74□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 APIPQ96GX9 242 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 ZNF382Q96SR6 550 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 LMF2Q9BU23 707 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 EBPLQ9BY08 206 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 ACPTQ9BZG2 426 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 MIEF1Q9NQG6 463 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 DDX18Q9NVP1 670 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 NINJ2Q9NZG7 142 aa6.74□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 ZNF225Q9UK10 706 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 VDAC3Q9Y277 283 aa6.74□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 VPS13CQ709C8 3753 aa6.73□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 KCNH1O95259 989 aa6.73□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 C12orf49Q9H741 205 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 SIRT5Q9NXA8 310 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 A0A1W2PP18 115 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 SERTM1A2A2V5 107 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 TRIM49D1C9J1S8 452 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 UPK1AO00322 258 aa6.73□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 PKNOX1P55347 436 aa6.73□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 SPDYAQ5MJ70 313 aa6.73□□□□□ -1.33
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TMOD2-204ENST00000560576 OR2L13Q8N349 312 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 GTPBP8Q8N3Z3 284 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 MMGT1Q8N4V1 131 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 PAFAH2Q99487 392 aa6.73□□□□□ -1.33
TMOD2-204ENST00000560576 FUT8Q9BYC5 575 aa6.73□□□□□ -1.33
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