RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555542.5

PRKCH-216, Transcript of protein kinase C eta, humanhuman

TSL 4

Gene PRKCH, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCH-216ENST00000555542 B3GALT5-AS1P59052 145 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF844Q08AG5 666 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PTGR1Q14914 329 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 BCL2A1Q16548 175 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 C6orf136Q5SQH8 315 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CPTPQ5TA50 214 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 IL23RQ5VWK5 629 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 FBXW10Q5XX13 1052 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 MFSD12Q6NUT3 480 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 LUZP2Q86TE4 346 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 COX18Q8N8Q8 333 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 SLC16A11Q8NCK7 471 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 OR5M1Q8NGP8 315 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 SMPDL3BQ92485 455 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 GIMAP5Q96F15 307 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PIGQQ9BRB3 760 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 G6PC3Q9BUM1 346 aa22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 TUBAL3A6NHL2 446 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 NDUFB5O43674 189 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ETV4P43268 484 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 SERPINB4P48594 390 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 DUSP5Q16690 384 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 SPDYE7PQ495Y7 208 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 FAM222BQ8WU58 562 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 FAM120BQ96EK7 910 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 C16orf58Q96GQ5 468 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 UCN2Q96RP3 112 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 NTMQ9P121 344 aa22.11■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 SLC22A20A6NK97 555 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 LINC01387J3KSC0 135 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CTAG2O75638 210 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 KCNK2O95069 426 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 LAMP1P11279 417 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 MLC1Q15049 377 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CHI3L2Q15782 390 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 GATSQ8NAP1 163 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 OR6Y1Q8NGX8 325 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 HHATLQ9HCP6 504 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ZNF337Q9Y3M9 751 aa22.1■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 OR2M5A3KFT3 312 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CFLARO15519 480 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 MAP3K8P41279 467 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 DIO3P55073 304 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 TP53BP2Q13625 1128 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CEP85LQ5SZL2 805 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 APOOLQ6UXV4 268 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 NATD1Q8N6N6 113 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 OR5P2Q8WZ92 322 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 NRGNQ92686 78 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ZBTB9Q96C00 473 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PPP1R36Q96LQ0 422 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PIGMQ9H3S5 423 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 VDAC3Q9Y277 283 aa22.09■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 ALG1L2C9J202 215 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 SCDO00767 359 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 HCRTR2O43614 444 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 TGM6O95932 706 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 SERPINE1P05121 402 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PRPS1L1P21108 318 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 SORDQ00796 357 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CCNJQ5T5M9 372 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 OR2A2Q6IF42 318 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 KRTCAP2Q8N6L1 136 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 OR4C3Q8NH37 302 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PINK1Q9BXM7 581 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 KCNK9Q9NPC2 374 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 JKAMPQ9P055 326 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 STOML1Q9UBI4 398 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 PACSIN3Q9UKS6 424 aa22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PRKCH-216ENST00000555542 POLQO75417 2590 aa22.07■■□□□ 1.12
PRKCH-216ENST00000555542 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PRKCH-216ENST00000555542 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa22.07■■□□□ 1.12
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