RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533628.5

RPUSD4-208, Transcript of RNA pseudouridylate synthase domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RPUSD4, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD4-208ENST00000533628 COX4I1P13073 169 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 CD46P15529 392 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 PTGDSP41222 190 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 TMED10P49755 219 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 FUT5Q11128 374 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 RUNDC3AQ59EK9 446 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 REP15Q6BDI9 236 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM81Q6P7N7 255 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 CROCCP3Q8IVE0 287 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 C10orf111Q8N326 155 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 POU5F2Q8N7G0 328 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 COX18Q8N8Q8 333 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 TEX19Q8NA77 164 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 OR52N2Q8NGI0 321 aa11.67□□□□□ -0.54
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RPUSD4-208ENST00000533628 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
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RPUSD4-208ENST00000533628 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa11.67□□□□□ -0.54
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RPUSD4-208ENST00000533628 A0A1W2PPB8 328 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 A0A1W2PRS3 328 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 KIR3DP1A8MWS1 328 aa11.67□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 CLIC1O00299 241 aa11.67□□□□□ -0.54
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RPUSD4-208ENST00000533628 CYP4B1P13584 511 aa11.67□□□□□ -0.54
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RPUSD4-208ENST00000533628 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP11.67□□□□□ -0.54
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RPUSD4-208ENST00000533628 SLC22A10Q63ZE4 541 aa11.67□□□□□ -0.54
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RPUSD4-208ENST00000533628 DUXAA6NLW8 204 aa11.66□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
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RPUSD4-208ENST00000533628 SELPLGQ14242 412 aa11.66□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 BICRALQ6AI39 1079 aa11.66□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 GALNT10Q86SR1 603 aa11.66□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 ARHGAP24Q8N264 748 aa11.66□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 TMEM178AQ8NBL3 297 aa11.66□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 GRHL3Q8TE85 626 aa11.66□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 XAGE5Q8WWM1 108 aa11.66□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 RCN3Q96D15 328 aa11.66□□□□□ -0.54
RPUSD4-208ENST00000533628 ANGPTL4Q9BY76 406 aa11.66□□□□□ -0.54
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