RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517316.1

IGHVII-40-1-201, Transcript of immunoglobulin heavy variable (II)-40-1 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGHVII-40-1, Length 58 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A0A1W2PNN7 141 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SAGE2PA6NJ88 616 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 A8MXE2 369 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPIPA5E9PKD4 350 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EI24O14681 340 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 BET1O15155 118 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR46O15213 610 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EIF3JO75822 258 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNFSF13O75888 250 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MPZL1O95297 269 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANP32DO95626 131 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 STARD3NLO95772 234 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ECDO95905 644 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHRNA1P02708 482 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CD55P08174 381 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GSTA2P09210 222 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RNH1P13489 461 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CRISP2P16562 243 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HPDP32754 393 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPL29P47914 159 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RPS6P62753 249 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CYP51A1Q16850 503 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPR139Q6DWJ6 353 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERN2Q76MJ5 926 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 LCA5Q86VQ0 697 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SMC5Q8IY18 1101 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q8N976 141 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR6M1Q8NGM8 313 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF461Q8TAF7 563 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RDH11Q8TC12 318 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 P3H4Q92791 437 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GGHQ92820 318 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MCHR2Q969V1 340 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPS33AQ96AX1 596 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SKA1Q96BD8 255 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RMDN1Q96DB5 314 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PELI1Q96FA3 418 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TIMD4Q96H15 378 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TMEM80Q96HE8 168 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACCSQ96QU6 501 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FEM1AQ9BSK4 669 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 APOOQ9BUR5 198 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CCDC68Q9H2F9 335 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 VPS18Q9P253 973 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MBD2Q9UBB5 411 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PURGQ9UJV8 347 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ERVK-19Q9WJR5 959 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa0.03□□□□□ -2.4
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 DOCK9Q9BZ29 2069 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C7orf66A4D0T2 115 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C19orf81C9J6K1 198 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ANGPTL7O43827 346 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KIAA0754O94854 1291 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 IGSF6O95976 241 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 TLX1NBP0CAT3 122 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLULP15104 373 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
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IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLHL30Q0D2K2 578 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ACKR1Q16570 336 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 COX19Q49B96 90 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GPAT3Q53EU6 434 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 MPPE1Q53F39 396 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KRT80Q6KB66 452 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 C1orf94Q6P1W5 598 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PNCKQ6P2M8 343 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 HACD2Q6Y1H2 254 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ZNF621Q6ZSS3 439 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 SLC22A16Q86VW1 577 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 Q8NDZ9 215 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 NPBQ8NG41 125 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 GLYATL1Q969I3 302 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FAM46BQ96A09 425 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 ULK4Q96C45 1275 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 OR10C1Q96KK4 312 aa0.02□□□□□ -2.41
IGHVII-40-1-201ENST00000517316 FUNDC2Q9BWH2 189 aa0.02□□□□□ -2.41
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