RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516230.1

RNU6-287P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 287, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-287P, Length 98 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 FOXF1Q12946 379 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF235Q14590 738 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 PCLAFQ15004 111 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 GPAT3Q53EU6 434 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMEM255AQ5JRV8 349 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CASC10Q5T4H9 136 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM46CQ5VWP2 391 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM220AQ7Z4H9 259 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 LCA5Q86VQ0 697 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 VSIG1Q86XK7 387 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TTC39CQ8N584 583 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM86B1Q8N7N1 296 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 C1orf64Q8NEQ6 169 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 NCOA7Q8NI08 942 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SELENOMQ8WWX9 145 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 IL1F10Q8WWZ1 152 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATP6V0A1Q93050 837 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TMCO6Q96DC7 493 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC39A13Q96H72 371 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SPATA33Q96N06 139 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 C7orf26Q96N11 449 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SULT4A1Q9BR01 284 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TEX12Q9BXU0 123 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CXXC4Q9H2H0 198 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 UNC45AQ9H3U1 944 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 FN3KQ9H479 309 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MINDY3Q9H8M7 445 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 FANCFQ9NPI8 374 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 GDF3Q9NR23 364 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR1A1Q9P1Q5 309 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TRPC4Q9UBN4 977 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 GIMAP2Q9UG22 337 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TUBGCP4Q9UGJ1 667 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 BTNL2Q9UIR0 455 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 GNPTGQ9UJJ9 305 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDR45Q9Y484 360 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR1A2Q9Y585 309 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 PCNX1Q96RV3 2341 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 COL6A6A6NMZ7 2263 aa-0.27□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF407Q9C0G0 2248 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SCN2AQ99250 2005 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CARMIL3Q8ND23 1372 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SCN4AP35499 1836 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 A0A1W2PQ09 198 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 H0YIG0 161 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 M0R296 226 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CYB561D2O14569 222 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF263O14978 683 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 HCN1O60741 890 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TBX19O60806 448 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ENTPD3O75355 529 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 AKAP3O75969 853 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SCGB1D1O95968 90 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MOSP00540 346 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 GSTA2P09210 222 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 GIPP09681 153 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 OR52Z1P0C646 297 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 THRBP10828 461 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 TSPAN8P19075 237 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 PAX3P23760 479 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 GCH1P30793 250 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 KIR2DS2P43631 304 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF83P51522 516 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CSNK1G2P78368 415 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SETQ01105 290 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF85Q03923 595 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SMARCB1Q12824 385 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 IHHQ14623 411 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 MEF2DQ14814 521 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 PSG5Q15238 335 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 FAM120AOSQ5T036 256 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 WDR78Q5VTH9 848 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 C1orf94Q6P1W5 598 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 C6orf89Q6UWU4 347 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 BTNL8Q6UX41 500 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 Q6ZRG5 221 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ZNF621Q6ZSS3 439 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 ARMCX2Q7L311 632 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CHST3Q7LGC8 479 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CAMKMTQ7Z624 323 aa-0.28□□□□□ -2.45
RNU6-287P-201ENST00000516230 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa-0.28□□□□□ -2.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.5 ms