RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	KIT	P10721	976 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	CPN1	P15169	458 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	ME2	P23368	584 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	CHI3L1	P36222	383 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	PTGDS	P41222	190 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	STX1B	P61266	288 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	TXNL4A	P83876	142 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	BCL2A1	Q16548	175 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	ACSF3	Q4G176	576 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	CES4A	Q5XG92	561 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	NSUN5P2	Q63ZY6	315 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2A2	Q6IF42	318 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	FIGNL1	Q6PIW4	674 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	C16orf62	Q7Z3J2	963 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	CAMKMT	Q7Z624	323 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	GRAMD2A	Q8IUY3	354 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	CCDC71	Q8IV32	467 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	MCEMP1	Q8IX19	187 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	KRTCAP2	Q8N6L1	136 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	WDSUB1	Q8N9V3	476 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	OR8J2	Q8NGG1	315 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXO30	Q8TB52	745 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	PIWIL2	Q8TC59	973 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	YIPF4	Q9BSR8	244 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	MED11	Q9P086	117 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF629	Q9UEG4	869 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	HAO1	Q9UJM8	370 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	EDAR	Q9UNE0	448 aa		10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A0G2JNJ9	132 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF103-CHMP3	A0A140T963	221 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	GXYLT2	A0PJZ3	443 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	TMEM247	A6NEH6	219 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	HMGB1P1	B2RPK0	211 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	ALG1L2	C9J202	215 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246		E9PBE3	544 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	FADS1	O60427	444 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	NME6	O75414	186 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	KCNK2	O95069	426 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	ANP32D	O95626	131 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	IDO1	P14902	403 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	TBXA2R	P21731	343 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	MATN1	P21941	496 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	BMP5	P22003	454 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	TCEA1	P23193	301 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	SOX18	P35713	384 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	MYBPH	Q13203	477 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	FGFBP1	Q14512	234 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	SGCB	Q16585	318 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	DUSP5	Q16690	384 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	GRAMD1B	Q3KR37	738 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	FLYWCH1	Q4VC44	716 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	DESI1	Q6ICB0	168 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	OGFOD2	Q6N063	350 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	NCCRP1	Q6ZVX7	275 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	MARCH3	Q86UD3	253 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	KIF18B	Q86Y91	864 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF614	Q8N883	585 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC16A11	Q8NCK7	471 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	OR2M3	Q8NG83	312 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	ZBTB8A	Q96BR9	441 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	TESC	Q96BS2	214 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	ATP6V1G3	Q96LB4	118 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	SORT1	Q99523	831 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF559	Q9BR84	538 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	PRRG4	Q9BZD6	226 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	RMND5A	Q9H871	391 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	FANCF	Q9NPI8	374 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	PNPO	Q9NVS9	261 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	PAQR5	Q9NXK6	330 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246		Q9UFV3	132 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		10.3	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	GIMAP1-GIMAP5	A0A087WTJ2	511 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246		A0A1W2PQD3	144 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	GJE1	A6NN92	205 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246		H3BML4	177 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	KLF11	O14901	512 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	DIAPH2	O60879	1101 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	STX11	O75558	287 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	OXSR1	O95747	527 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	ACP2	P11117	423 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	FCGR2A	P12318	317 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	UQCRC2	P22695	453 aa		10.29	□□□□□ -0.76
TTLL3-231	ENST00000496246	CTSS	P25774	331 aa		10.29	□□□□□ -0.76

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms