RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475959.1

GTPBP1-208, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 2

Gene GTPBP1, Length 475 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-208	ENST00000475959	TIMP4	Q99727	224 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	INPP5K	Q9BT40	448 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRDM14	Q9GZV8	571 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DSN1	Q9H410	356 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC6A13	Q9NSD5	602 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	GIN1	Q9NXP7	522 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	MED11	Q9P086	117 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DKKL1	Q9UK85	242 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	HEATR5A	Q86XA9	2040 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	MED12L	Q86YW9	2145 aa		10.1	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DIAPH2	O60879	1101 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CPSF4	O95639	269 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ANGPTL1	O95841	491 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	GLI4	P10075	376 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CD1E	P15812	388 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SRD5A2	P31213	254 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	STAR	P49675	285 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	GFRA1	P56159	465 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PMPCA	Q10713	525 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DCST2	Q5T1A1	773 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	WLS	Q5T9L3	541 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	EPGN	Q6UW88	154 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	B3GNT6	Q6ZMB0	384 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR5M1	Q8NGP8	315 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR14L1P	Q8NHC6	308 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACTRT2	Q8TDY3	377 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARSG	Q96EG1	525 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDYHV1	Q96HA8	205 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLC35G5	Q96KT7	338 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	STAC	Q99469	402 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	G6PC3	Q9BUM1	346 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	PIGU	Q9H490	435 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	DUSP22	Q9NRW4	184 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		10.09	□□□□□ -0.79
GTPBP1-208	ENST00000475959	INTS1	Q8N201	2190 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959		A0A0G2JNJ9	132 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	TTC36	A6NLP5	189 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	ALG1L2	C9J202	215 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	SLCO1B7	G3V0H7	640 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZIC3	O60481	467 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	WDR1	O75083	606 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNFRSF21	O75509	655 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	CBR3	O75828	277 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	CLDN14	O95500	239 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	DPP4	P27487	766 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	LHX2	P50458	406 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	SMS	P52788	366 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	PSMD4	P55036	377 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	ART3	Q13508	389 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	DPY19L1	Q2PZI1	675 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	NDUFAF6	Q330K2	333 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	GTDC1	Q4AE62	458 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	SAXO2	Q658L1	398 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNFAIP8L2	Q6P589	184 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	ZCCHC12	Q6PEW1	402 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	ARSK	Q6UWY0	536 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	C6orf120	Q7Z4R8	191 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	SPATA19	Q7Z5L4	167 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	IFNE	Q86WN2	208 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	NATD1	Q8N6N6	113 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	ABTB1	Q969K4	478 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	THOC1	Q96FV9	657 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	SH3YL1	Q96HL8	342 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	CCDC115	Q96NT0	180 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	BTBD2	Q9BX70	525 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	TBL1XR1	Q9BZK7	514 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	UCK2	Q9BZX2	261 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	OR51I1	Q9H343	314 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959		Q9UFV3	132 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	KCNE5	Q9UJ90	142 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	CAMK2A	Q9UQM7	478 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		10.08	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959		H0YC42	278 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	GSN	P06396	782 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	PGR	P06401	933 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	10.07	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	PRF1	P14222	555 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	IDO1	P14902	403 aa		10.07	□□□□□ -0.8
GTPBP1-208	ENST00000475959	HK1	P19367	917 aa		10.07	□□□□□ -0.8

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