RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SCO2O43819 266 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FADS1O60427 444 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 IL33O95760 270 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 EPPINO95925 133 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 IDO1P14902 403 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 BMP5P22003 454 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SRD5A2P31213 254 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RFX3P48380 749 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GAS1P54826 345 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PSMD4P55036 377 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 WNT3P56703 355 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 C21orf58P58505 322 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TLE4Q04727 773 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 STX5Q13190 355 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GAB1Q13480 694 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RCAN2Q14206 197 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PTGR1Q14914 329 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 VPS26BQ4G0F5 336 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CPTPQ5TA50 214 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR5M10Q6IEU7 315 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SEM1Q6ZVN7 128 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NAXEQ8NCW5 288 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TNIP2Q8NFZ5 429 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 OR4K17Q8NGC6 315 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CEP70Q8NHQ1 597 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FBXO30Q8TB52 745 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GPR151Q8TDV0 419 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ACTRT2Q8TDY3 377 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 C14orf79Q96F83 325 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 WDYHV1Q96HA8 205 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 C3orf30Q96M34 536 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TRIB1Q96RU8 372 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf50Q9BV19 199 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NUF2Q9BZD4 464 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 AKTIPQ9H8T0 292 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 C3orf14Q9HBI5 128 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ACSS1Q9NUB1 689 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM45AQ9NWC5 275 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TRIM33Q9UPN9 1127 aa6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 SPG11Q96JI7 2443 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GIMAP1-GIMAP5A0A087WTJ2 511 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GXYLT2A0PJZ3 443 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MBD3L4A6NDZ8 208 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MBD3L3A6NE82 208 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MBD3L5A6NJ08 208 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CD8B2A6NJW9 211 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 B4DXG7 233 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 EMC8O43402 210 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 KCNH1O95259 989 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 UTS2O95399 124 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 IL2RAP01589 272 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ACP2P11117 423 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CPN1P15169 458 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DPP4P27487 766 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GABRA3P34903 492 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 TIMP3P35625 211 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CLK3P49761 638 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 LHX2P50458 406 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ASCL1P50553 236 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PRKAG1P54619 331 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GFRA1P56159 465 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 DSCR4P56555 118 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 STX1BP61266 288 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 PRR5P85299 388 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MYBPHQ13203 477 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MLC1Q15049 377 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 GSTA3Q16772 222 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ANXA8L1Q5VT79 327 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 IL23RQ5VWK5 629 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 NXNQ6DKJ4 435 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 MFSD12Q6NUT3 480 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 AAGABQ6PD74 315 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 ENPP6Q6UWR7 440 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 FADS6Q8N9I5 356 aa6.95□□□□□ -1.3
SGMS1-201ENST00000361543 CDRT4Q8N9R6 151 aa6.95□□□□□ -1.3
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