RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292535.11

CUX1-201, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CUX1, Length 13,747 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-201ENST00000292535 PTH2RP49190 550 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 CLDN8P56748 225 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 BLOC1S1P78537 153 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 MPEG1Q2M385 716 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 RTL10Q7L3V2 364 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 CNIH3Q8TBE1 160 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 NEURL4Q96JN8 1562 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 CD300LBA8K4G0 201 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 HEPACAM2A8MVW5 462 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 OR6T1Q8NGN1 323 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 SDSLQ96GA7 329 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 EXTL2Q9UBQ6 330 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 ATG4BQ9Y4P1 393 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 PPP1R3DO95685 299 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 CDRT4Q8N9R6 151 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 CWH43Q9H720 699 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 GCM1Q9NP62 436 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 KNG1P01042 644 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 STK19P49842 368 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 SGSHP51688 502 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 IL13RA1P78552 427 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 TMEM150AQ86TG1 271 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 UCN3Q969E3 161 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 MRC1P22897 1456 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 PCBD1P61457 104 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 METTL11BQ5VVY1 283 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 TMEM139Q8IV31 216 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 SLC6A5Q9Y345 797 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 ABCC6O95255 1503 aa8.84□□□□□ -0.99
CUX1-201ENST00000292535 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP8.84□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 A0A1W2PPK0 400 aa8.84□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 GAAP10253 952 aa8.84□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 DBPQ10586 325 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 NLGN4XQ8N0W4 816 aa8.84□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 A8MVM7 634 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 EPHA4P54764 986 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 SCAPQ12770 1279 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 XKR5Q6UX68 686 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 OR14A16Q8NHC5 309 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 ZNF516Q92618 1163 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 KIAA0513O60268 411 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 ICAM2P13598 275 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 SYN1P17600 705 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 RAB3BP20337 219 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 PRAMEF8Q5VWM4 474 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 MAL2Q969L2 176 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 TWNKQ96RR1 684 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 KCNJ16Q9NPI9 418 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 GABRR1P24046 479 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 ZNF423Q2M1K9 1284 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 FAM3CQ92520 227 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 TEPSINQ96N21 525 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 SLC25A31Q9H0C2 315 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 FOXO6A8MYZ6 492 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 OLFM2O95897 454 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 CKMT1AP12532 417 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 GRIN2CQ14957 1233 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 CACNG4Q9UBN1 327 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 A0A1W2PPH5 198 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 TRAPPC2LH3BP13 241 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 KITLGP21583 273 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 RELL1Q8IUW5 271 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 OR11L1Q8NGX0 322 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 ALG8Q9BVK2 526 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 LCATP04180 440 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 GGT1P19440 569 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 SPHARQ15513 63 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 TMEM71Q6P5X7 295 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 ZFAND1Q8TCF1 268 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 GPR148Q8TDV2 347 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 DYNLRB1Q9NP97 96 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 PENKP01210 267 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 BPIP17213 487 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 POU3F2P20265 443 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 PPP1R8Q12972 351 aaKnown RBP8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 GPR176Q14439 515 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 SLX4IPQ5VYV7 408 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 LYSMD4Q5XG99 296 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 SMOQ99835 787 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 AIG1Q9NVV5 245 aa8.83□□□□□ -1
CUX1-201ENST00000292535 CD46P15529 392 aa8.83□□□□□ -1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms