RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273317.4

LIMD1-201, Transcript of LIM domains containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LIMD1, Length 11,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1-201ENST00000273317 GPR148Q8TDV2 347 aa7.56□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 A8MVJ9 347 aa7.56□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 PEX10O60683 326 aa7.56□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 PRKAR1BP31321 381 aa7.56□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 POU3F4P49335 361 aa7.56□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 CXCR4P61073 352 aa7.56□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 DOC2AQ14183 400 aa7.56□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
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LIMD1-201ENST00000273317 SPO11Q9Y5K1 396 aa7.56□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 A0A0D9SEW6 157 aa7.56□□□□□ -1.2
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LIMD1-201ENST00000273317 ITGB4P16144 1822 aa7.56□□□□□ -1.2
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LIMD1-201ENST00000273317 MR1Q95460 341 aa7.55□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 MUL1Q969V5 352 aa7.55□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 ELMOD3Q96FG2 381 aa7.55□□□□□ -1.2
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LIMD1-201ENST00000273317 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa7.55□□□□□ -1.2
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LIMD1-201ENST00000273317 TAS2R19P59542 299 aa7.55□□□□□ -1.2
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LIMD1-201ENST00000273317 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 CEP250Q9BV73 2442 aa7.55□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 FUOMA2VDF0 154 aa7.55□□□□□ -1.2
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LIMD1-201ENST00000273317 GRIN2CQ14957 1233 aa7.55□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 RAET1LQ5VY80 246 aa7.55□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 DPF1Q92782 380 aa7.55□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 PRRC1Q96M27 445 aa7.55□□□□□ -1.2
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LIMD1-201ENST00000273317 A0A0D9SG52 128 aa7.55□□□□□ -1.2
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LIMD1-201ENST00000273317 NLKQ9UBE8 527 aa7.55□□□□□ -1.2
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LIMD1-201ENST00000273317 COCHO43405 550 aa7.55□□□□□ -1.2
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LIMD1-201ENST00000273317 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 C3orf58Q8NDZ4 430 aa7.55□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 LARP4Q71RC2 724 aaKnown RBP eCLIP7.55□□□□□ -1.2
LIMD1-201ENST00000273317 SLC5A8Q8N695 610 aa7.55□□□□□ -1.2
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