RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000599560.5

NUP62-216, Transcript of nucleoporin 62, human

TSL 2

Gene NUP62, Length 562 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NUP62-216	ENST00000599560	SMAD9	O15198	467 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	FADS1	O60427	444 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	ERAL1	O75616	437 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PIAS1	O75925	651 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	ATP1B1	P05026	303 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	TUBB	P07437	444 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	CREB1	P16220	341 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	SHC1	P29353	583 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PIK3CB	P42338	1070 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PIK3CG	P48736	1102 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PPA1	Q15181	289 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PDCD2	Q16342	344 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	RINL	Q6ZS11	566 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	TUSC5	Q8IXB3	177 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PDPR	Q8NCN5	879 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	UBE2E3	Q969T4	207 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	BTBD9	Q96Q07	612 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	BPESC1	Q9GZL8	116 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	DERL2	Q9GZP9	239 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	FANCF	Q9NPI8	374 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	CD274	Q9NZQ7	290 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	ARMCX1	Q9P291	453 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PRSS50	Q9UI38	385 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	CFL2	Q9Y281	166 aa		10.69	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	LINC01387	J3KSC0	135 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	IPO7	O95373	1038 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	CSF3	P09919	207 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PYGB	P11216	843 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	CD1D	P15813	335 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF23	P17027	643 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	IL12B	P29460	328 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PDLIM4	P50479	330 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PNLIPRP2	P54317	469 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	ITGAD	Q13349	1161 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	CARTPT	Q16568	116 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	C6orf163	Q5TEZ5	329 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	MARCH3	Q86UD3	253 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	NUDT13	Q86X67	352 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	TMEM139	Q8IV31	216 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	FBXL14	Q8N1E6	418 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	RNF214	Q8ND24	703 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	OR2W6P	Q8NHA6	318 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	DUSP19	Q8WTR2	217 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	CNRIP1	Q96F85	164 aa	Predicted RBP	10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	CFAP36	Q96G28	342 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	VSTM2L	Q96N03	204 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	METRN	Q9UJH8	293 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	VDAC3	Q9Y277	283 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		10.68	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560		A0A1W2PR80	420 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	ADAMDEC1	O15204	470 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PHGDH	O43175	533 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	KLK1	P06870	262 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	SERPINB1	P30740	379 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	FABP6	P51161	128 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	ARFIP1	P53367	373 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	LGALS3BP	Q08380	585 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	EFR3A	Q14156	821 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	MST1L	Q2TV78	715 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	IQCC	Q4KMZ1	466 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	SLC48A1	Q6P1K1	146 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	SLC22A25	Q6T423	547 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	TREML4	Q6UXN2	200 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	APOOL	Q6UXV4	268 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PEG10	Q86TG7	708 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	FAM216A	Q8WUB2	273 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF681	Q96N22	645 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	GLRX2	Q9NS18	164 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	PCDHA9	Q9Y5H5	950 aa		10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	IGF2BP2	Q9Y6M1	599 aa	Known RBP eCLIP	10.67	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	10.66	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	SYNGR4	O95473	234 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	TTC4	O95801	387 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	CXCR5	P32302	372 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF83	P51522	516 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	CUL3	Q13618	768 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	ZSWIM7	Q19AV6	140 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	ZNF628	Q5EBL2	1059 aa		10.66	□□□□□ -0.7
NUP62-216	ENST00000599560	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		10.66	□□□□□ -0.7

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