RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580654.5

SMARCE1-217, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 5

Gene SMARCE1, Length 554 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-217ENST00000580654 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 OR52B6Q8NGF0 335 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 OR10D3Q8NH80 312 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 HES6Q96HZ4 224 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 SIGLEC10Q96LC7 697 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 ADOQ96SZ5 270 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 NPAS1Q99742 590 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 EFCAB11Q9BUY7 163 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CAPS2Q9BXY5 557 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 SMYD2Q9NRG4 433 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 GLRX2Q9NS18 164 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 MAT2BQ9NZL9 334 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 VWA7Q9Y334 891 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 PLLPQ9Y342 182 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 AP4B1Q9Y6B7 739 aa6.76□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 GOLGA8MH3BSY2 632 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 SCO2O43819 266 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CXCL13O43927 109 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 REM1O75628 298 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 OPN1LWP04000 364 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 FAM58BPP0C7Q3 252 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CTAGE8P0CG41 777 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CT45A8P0DMV1 189 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CT45A9P0DMV2 189 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 PCNAP12004 261 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 BMP4P12644 408 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 EDNRAP25101 427 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 PIK3R1P27986 724 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 MAGEA3P43357 314 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 PPICP45877 212 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 KCNJ1P48048 391 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 HSPA7P48741 367 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 XKP51811 444 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CDH15P55291 814 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 TPM4P67936 248 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 DUSP2Q05923 314 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 ITGADQ13349 1161 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 LAPTM5Q13571 262 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF460Q14592 562 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 TBCCQ15814 346 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 STK11Q15831 433 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 MST1LQ2TV78 715 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CT45A2Q5DJT8 189 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 OR52E8Q6IFG1 317 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 USP43Q70EL4 1123 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 EXOC3L1Q86VI1 746 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CTAGE4Q8IX94 777 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 OR7G3Q8NG95 312 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 ANKRD49Q8WVL7 239 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 RGMAQ96B86 450 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 DTNBP1Q96EV8 351 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CMTM7Q96FZ5 175 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 ESM1Q9NQ30 184 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 FLRT3Q9NZU0 649 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 BCAP29Q9UHQ4 241 aa6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 A0A0J9YW62 118 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 FADS1O60427 444 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 LYZL6O75951 148 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 GBAP04062 536 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 TACSTD2P09758 323 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 MLNP12872 115 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CPMP14384 443 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 ZFP36P26651 326 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 LIMS1P48059 325 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 SERPINB4P48594 390 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 RAP1GDS1P52306 607 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CORO7P57737 925 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 IRF8Q02556 426 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 GANABQ14697 944 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 SLMAPQ14BN4 828 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 SPA17Q15506 151 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 TGFBIQ15582 683 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CARTPTQ16568 116 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 CCNG2Q16589 344 aa6.74□□□□□ -1.33
SMARCE1-217ENST00000580654 OCLNQ16625 522 aa6.74□□□□□ -1.33
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