RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557168.1

TRAV30-201, Transcript of T cell receptor alpha variable 30, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRAV30, Length 337 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV30-201ENST00000557168 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF404Q494X3 552 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF385BQ569K4 471 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PAGE2BQ5JRK9 111 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TMEM201Q5SNT2 666 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GCNT6Q5T4J0 391 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 FRMPD2BQ6IN97 320 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TRIM40Q6P9F5 258 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TMEM220Q6QAJ8 160 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CD300LDQ6UXZ3 194 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 USP43Q70EL4 1123 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 IKBIPQ70UQ0 350 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GALNT5Q7Z7M9 940 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 RNF175Q8N4F7 328 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SLC5A8Q8N695 610 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 OR10G2Q8NGC3 310 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 OR10Q1Q8NGQ4 319 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 OR9A1PQ8NGU1 263 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 NDNFQ8TB73 568 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF480Q8WV37 535 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 THAP4Q8WY91 577 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 UBE2FQ969M7 185 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SH3KBP1Q96B97 665 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TAMM41Q96BW9 452 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 AP2M1Q96CW1 435 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 FOPNLQ96NB1 174 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 FEVQ99581 238 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PIP5K1AQ99755 562 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 MAP3K3Q99759 626 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 FUZQ9BT04 418 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 COPS4Q9BT78 406 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CDADC1Q9BWV3 514 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 EBPLQ9BY08 206 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CCDC90BQ9GZT6 254 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 DSN1Q9H410 356 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SLC25A19Q9HC21 320 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 EXD2Q9NVH0 621 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TAS2R7Q9NYW3 318 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SELENONQ9NZV5 590 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 RARRES3Q9UL19 164 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 MKLN1Q9UL63 735 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TRAPPC4Q9Y296 219 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 WDR37Q9Y2I8 494 aa4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ABCA4P78363 2273 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PCM1Q15154 2024 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SLC35F4A4IF30 521 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 EFCAB10A6NFE3 127 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 AGAP5A6NIR3 686 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 OR52A4PA6NMU1 304 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 C21orf140B9A014 251 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 DSCR3O14972 297 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 AIREO43918 545 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SCRG1O75711 98 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 UPK1BO75841 260 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 WISP2O76076 250 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SLITRK5O94991 958 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 DIRAS1O95057 198 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 VIPP01282 170 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ANKRD34CP0C6C1 535 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GAAP10253 952 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 F3P13726 295 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ETFAP13804 333 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 COX6B1P14854 86 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PSMB9P28065 219 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PDHA2P29803 388 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 SERPINB1P30740 379 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 RRM2P31350 389 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 HSD17B2P37059 387 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 PSMD7P51665 324 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CRISP1P54107 249 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 EPHA4P54764 986 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 VBP1P61758 197 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 NCS1P62166 190 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 CDK6Q00534 326 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 ZNF763Q0D2J5 394 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 C2orf80Q0P641 193 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 RPA4Q13156 261 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 GAB1Q13480 694 aa4.64□□□□□ -1.67
TRAV30-201ENST00000557168 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.4 ms