RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548025.5

MARF1-205, Transcript of meiosis regulator and mRNA stability factor 1, human

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene MARF1, Length 5,891 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MARF1-205	ENST00000548025	ROPN1L	Q96C74	230 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	KATNBL1	Q9H079	304 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	POLR2J3	Q9H1A7	115 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	C12orf49	Q9H741	205 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	LRP5	O75197	1615 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025		J3QKU1	62 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	VAMP5	O95183	116 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	CDH12	P55289	794 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	MPP2	Q14168	576 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	OR8H2	Q8N162	312 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	FBXW8	Q8N3Y1	598 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	KATNB1	Q9BVA0	655 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	BTBD2	Q9BX70	525 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	SLC35E2B	P0CK96	405 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	TMIGD3	P0DMS9	266 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	PRF1	P14222	555 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	TSPAN33	Q86UF1	283 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	SLC15A4	Q8N697	577 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	CDRT15	Q96T59	188 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	WDR55	Q9H6Y2	383 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF442	Q9H7R0	627 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	ADAM29	Q9UKF5	820 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	CMAHP	Q9Y471	501 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	UNC119B	A6NIH7	251 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF883	P0CG24	379 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	EFNA3	P52797	238 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	TMEM176B	Q3YBM2	270 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	SSX6	Q7RTT6	188 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF570	Q96NI8	536 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	PDP1	Q9P0J1	537 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		10.03	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	FZD7	O75084	574 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	BCAS1	O75363	584 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	C6orf47	O95873	294 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	TRAF3	Q13114	568 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	ASTE1	Q2TB18	679 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	WBP2NL	Q6ICG8	309 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	GUSBP11	Q6P575	273 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	CMC1	Q7Z7K0	106 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	SVOPL	Q8N434	492 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	NSMAF	Q92636	917 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	TMEM185B	Q9H7F4	350 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		10.02	□□□□□ -0.8
MARF1-205	ENST00000548025	NRAP	Q86VF7	1730 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025		B4E171	279 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	CTNS	O60931	367 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	METTL18	O95568	372 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	PVR	P15151	417 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	SLC19A1	P41440	591 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	TSPAN7	P41732	249 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	TAS2R39	P59534	338 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	FAM174B	Q3ZCQ3	159 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	IER5L	Q5T953	404 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	ZCCHC23	Q6ZST2	131 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	HCST	Q9UBK5	93 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	DHDH	Q9UQ10	334 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	MAFK	O60675	156 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	UNC5C	O95185	931 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	MYF5	P13349	255 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	MMP12	P39900	470 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	SCTR	P47872	440 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	GNG2	P59768	71 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	TSC22D1	Q15714	1073 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	BCL7A	Q4VC05	210 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	NIPAL3	Q6P499	406 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	PRR22	Q8IZ63	422 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF317	Q96PQ6	595 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	SMOC1	Q9H4F8	434 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	NIPAL2	Q9H841	368 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	TEX10	Q9NXF1	929 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	SLCO1C1	Q9NYB5	712 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	DHFR	P00374	187 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	CPT2	P23786	658 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	MEOX1	P50221	254 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	PITPNA	Q00169	270 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	ZNF844	Q08AG5	666 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	GANAB	Q14697	944 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	TGFBI	Q15582	683 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	HFE	Q30201	348 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		10.02	□□□□□ -0.81
MARF1-205	ENST00000548025	OR52R1	Q8NGF1	315 aa		10.02	□□□□□ -0.81

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