RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542113.1

NKRF-204, Transcript of NFKB repressing factor, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NKRF, Length 3,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKRF-204ENST00000542113 SYT14Q8NB59 555 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 MFSD9Q8NBP5 474 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 OR8D4Q8NGM9 314 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 OR8K5Q8NH50 307 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 PMM1Q92871 262 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 ELP4Q96EB1 424 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 WFDC6Q9BQY6 131 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 CTPS2Q9NRF8 586 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 SEMA4GQ9NTN9 838 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 CNIH4Q9P003 139 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 A0A0G2JN53 185 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 A0A1W2PR48 441 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 HIDE1A8MVS5 230 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 HPGDSO60760 199 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 RCBTB2O95199 551 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 PCDH8O95206 1070 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 DHFRP00374 187 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 CSF2P04141 144 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 APEX1P27695 318 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 NDUFS1P28331 727 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 ACSL1P33121 698 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 BCL6P41182 706 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 GCGRP47871 477 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 AVPR1BP47901 424 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 TGM4P49221 684 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 METAP1P53582 386 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 TNK1Q13470 666 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 TCEAL5Q5H9L2 206 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 SLC30A6Q6NXT4 461 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 COMTD1Q86VU5 262 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 TMEM145Q8NBT3 493 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 ING5Q8WYH8 240 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 GAL3ST3Q96A11 431 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 HYLS1Q96M11 299 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 ZSWIM3Q96MP5 696 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 KCNJ15Q99712 375 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 GDF15Q99988 308 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 YIPF4Q9BSR8 244 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 ACOXLQ9NUZ1 547 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 C14orf105Q9NVL8 296 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 BAIAP2Q9UQB8 552 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 ALG5Q9Y673 324 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 URADA6NGE7 173 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 INMT-MINDY4F8WBC2 141 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 STX11O75558 287 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 ADH1BP00325 375 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 AK1P00568 194 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 MT-ND5P03915 603 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 PEPDP12955 493 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 MC3RP41968 323 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 ACTC1P68032 377 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 ACTA1P68133 377 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 NTHL1P78549 312 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 GAS6Q14393 721 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 CREB3L2Q70SY1 520 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 TRIM48Q8IWZ4 208 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 NRMQ8IXM6 262 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 YIPF7Q8N8F6 280 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 GANCQ8TET4 914 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 INSM2Q96T92 566 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 CD180Q99467 661 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 NDC1Q9BTX1 674 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 HDHD2Q9H0R4 259 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 BABAM2Q9NXR7 383 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 NTMQ9P121 344 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 COPZ2Q9P299 210 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 WDR45Q9Y484 360 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 ATG4BQ9Y4P1 393 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 COLEC10Q9Y6Z7 277 aa6.35□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.34□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 IGLON5A6NGN9 336 aa6.34□□□□□ -1.39
NKRF-204ENST00000542113 UNC119BA6NIH7 251 aa6.34□□□□□ -1.39
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