RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538333.3

LIMK1-208, Transcript of LIM domain kinase 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LIMK1, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1-208ENST00000538333 SATB2Q9UPW6 733 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 MTCH2Q9Y6C9 303 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa13.06□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 H3BQ06 376 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 PRODHO43272 600 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 RAB36O95755 333 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 IFI6P09912 130 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 THEGLP0DJG4 465 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 TGM1P22735 817 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 TUBA3EQ6PEY2 450 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 TOR1AIP2Q8NFQ8 470 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM255BQ8WV15 326 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 CTHRC1Q96CG8 243 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 STACQ99469 402 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 ORAI3Q9BRQ5 295 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 FAM60AQ9NP50 221 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 NDUFB11Q9NX14 153 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 IL20Q9NYY1 176 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 KCNE5Q9UJ90 142 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF232Q9UNY5 417 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 SPACA6W5XKT8 324 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 TAF4O00268 1085 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 CT62P0C5K7 136 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 ETV5P41161 510 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 STAT5AP42229 794 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 CRYBB2P43320 205 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 RGS19P49795 217 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 ETV1P50549 477 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 BCAP31P51572 246 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 HHEXQ03014 270 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 GPR68Q15743 365 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 TRIM16LQ309B1 348 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 EIPR1Q53HC9 387 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 DCST2Q5T1A1 773 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 SLC36A4Q6YBV0 504 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 RRM2BQ7LG56 351 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 NRMQ8IXM6 262 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF619Q8N2I2 560 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 CDRT4Q8N9R6 151 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 STARD5Q9NSY2 213 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 FBXO34Q9NWN3 711 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 POMT2Q9UKY4 750 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 CFL2Q9Y281 166 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 GPR52Q9Y2T5 361 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 KNL1Q8NG31 2342 aa13.05□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 PIP5K1CO60331 668 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 STX11O75558 287 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 CTSBP07858 339 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 ALOX5P09917 674 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 GNSP15586 552 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 ST6GAL1P15907 406 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 NT5EP21589 574 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 GPR4P46093 362 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 C1orf61Q13536 156 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 C3orf38Q5JPI3 329 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 OOSP2Q86WS3 158 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 MINDY2Q8NBR6 621 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 OR4Q3Q8NH05 313 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 PIK3R3Q92569 461 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 SLC38A2Q96QD8 506 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 PRSS27Q9BQR3 290 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 GPR174Q9BXC1 333 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 QPCTLQ9NXS2 382 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 SEC14L4Q9UDX3 406 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 SLC7A7Q9UM01 511 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 TMEM131Q92545 1883 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 SGK494L7N484 410 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 MYL12BO14950 172 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 HNRNPCP07910 306 aaKnown RBP eCLIP13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 NID1P14543 1247 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 TYRP1P17643 537 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 HTR2AP28223 471 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 PRKCDQ05655 676 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 RAB40BQ12829 278 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 MINDY4Q4G0A6 757 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 FLYWCH1Q4VC44 716 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 KLHL22Q53GT1 634 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 ZNF620Q6ZNG0 422 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 PHC2Q8IXK0 858 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 ANKK1Q8NFD2 765 aa13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
LIMK1-208ENST00000538333 SEMA6CQ9H3T2 930 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.2 ms