RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 PKNOX1P55347 436 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 MYL6P60660 151 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 RPP38P78345 283 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 GSTO1P78417 241 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 MGAT3Q09327 533 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 BAMBIQ13145 260 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 GCKRQ14397 625 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 UGP2Q16851 508 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 DGUOKQ16854 277 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 PDPK2PQ6A1A2 396 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC30A6Q6NXT4 461 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF773Q6PK81 442 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 Q6ZSR9 355 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 BBS7Q8IWZ6 715 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 MCEMP1Q8IX19 187 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 UBQLNLQ8IYU4 475 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 LGI2Q8N0V4 545 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 LIX1Q8N485 282 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 RAB42Q8N4Z0 105 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 PACRGLQ8N7B6 248 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKFN1Q8N957 763 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 FNDC5Q8NAU1 212 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB44Q8NCP5 570 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 OR2T34Q8NGX1 318 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 PSMA8Q8TAA3 256 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 TEX47Q8TBZ9 253 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 GRHL3Q8TE85 626 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 DCAKDQ8WVC6 231 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 CYGBQ8WWM9 190 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 PROX1Q92786 737 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 CALML4Q96GE6 196 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 SERAC1Q96JX3 654 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 SGK494Q96LW2 274 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 PAFAH2Q99487 392 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 VGLL1Q99990 258 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 GAL3ST1Q99999 423 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 EBF4Q9BQW3 602 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 TTYH2Q9BSA4 534 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 APOL6Q9BWW8 343 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 RTN4RQ9BZR6 473 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 GPR88Q9GZN0 384 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 THAP2Q9H0W7 228 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 P2RY12Q9H244 342 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 HRH4Q9H3N8 390 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM96AQ9H5X1 160 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 SDHAF3Q9NRP4 125 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 IL37Q9NZH6 218 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM216Q9P0N5 145 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 STOML2Q9UJZ1 356 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 VPS28Q9UK41 221 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 GINS2Q9Y248 185 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 FLT4P35916 1363 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 TNRQ92752 1358 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 HEG1Q9ULI3 1381 aa3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 CLUHO75153 1309 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 UBE4BO95155 1302 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 ATAD5Q96QE3 1844 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 KIF13BQ9NQT8 1826 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 EP400Q96L91 3159 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 LOC100653049A0A140TA62 436 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT87PA6NCN2 255 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF487B1APH4 448 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 F5H6K3 240 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 I3L521 148 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 M0R3G1 203 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 E2F3O00716 465 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 AP3D1O14617 1153 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 AIM2O14862 343 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 ZBTB5O15062 677 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 ATP6V0E1O15342 81 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 CFLARO15519 480 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 SSX4O60224 188 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 SNNO75324 88 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 TOM1L1O75674 476 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 KRT34O76011 436 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 AP2A2O94973 939 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 SEC24AO95486 1093 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 OR52Z1P0C646 297 aa3.7□□□□□ -1.82
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.2 ms