RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 IDO1P14902 403 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 GSTA3Q16772 222 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 SPANXN4Q5MJ08 99 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM211Q6ICI0 200 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 BHLHB9Q6PI77 547 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 APOOLQ6UXV4 268 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 MRGPRGQ86SM5 289 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 CLECL1Q8IZS7 167 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 FADS6Q8N9I5 356 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 OR4C3Q8NH37 302 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 RMND5BQ96G75 393 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 MAGEB18Q96M61 343 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 OR52B2Q96RD2 323 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 TIMP4Q99727 224 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 BTBD2Q9BX70 525 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 OR2B2Q9GZK3 357 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 SLC6A15Q9H2J7 730 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 SDHAF3Q9NRP4 125 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 FLRT3Q9NZU0 649 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 BTNL2Q9UIR0 455 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 ACAD8Q9UKU7 415 aa15□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 CFLARO15519 480 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 WDR1O75083 606 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 TRAPPC6AO75865 159 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 UTS2O95399 124 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 KRT16P08779 473 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 TBXA2RP21731 343 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 SRD5A2P31213 254 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 S100A3P33764 101 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 SMSP52788 366 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 CRYZQ08257 329 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 ART3Q13508 389 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 EIPR1Q53HC9 387 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 WLSQ5T9L3 541 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 RTL6Q6ICC9 239 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 C6orf120Q7Z4R8 191 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 MARVELD2Q8N4S9 558 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 MIPOL1Q8TD10 442 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC115Q96NT0 180 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 YIPF4Q9BSR8 244 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 PRDM14Q9GZV8 571 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 SERHLQ9NQF3 203 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 FBXO34Q9NWN3 711 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 FBXL2Q9UKC9 423 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 PCDHGB4Q9UN71 923 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 CENPEQ02224 2701 aa14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 AHRRA9YTQ3 701 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 ALG1L2C9J202 215 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 ZIC3O60481 467 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 SLC22A3O75751 556 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 ACTL6AO96019 429 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 PGRP06401 933 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 GABRA1P14867 456 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 BMP7P18075 431 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 UQCRC2P22695 453 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 ACVR2AP27037 513 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 TRPC1P48995 793 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 CLK3P49761 638 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 GFRA1P56159 465 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 C17orf67Q0P5P2 114 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 LRRC74AQ0VAA2 488 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 TP53BP2Q13625 1128 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 GRAMD1BQ3KR37 738 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 C3P1Q6ZMU1 363 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 SZRD1Q7Z422 152 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 COX18Q8N8Q8 333 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 OR5M9Q8NGP3 310 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 ADAMTS15Q8TE58 950 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 STON2Q8WXE9 905 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 DTNBP1Q96EV8 351 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 G6PC3Q9BUM1 346 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 EXO5Q9H790 373 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 HHATLQ9HCP6 504 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 ZIM2Q9NZV7 527 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 FAM215AQ9Y5M1 114 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 KLF2Q9Y5W3 355 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 KCNE3Q9Y6H6 103 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 PCNX3Q9H6A9 2034 aa14.98□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 UNC79Q9P2D8 2635 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 A0A1W2PQD3 144 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 DUXAA6NLW8 204 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 FIGNL2A6NMB9 653 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 UBDO15205 165 aa14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ATG4B-216ENST00000475195 IL6P05231 212 aa14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms