RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 LILRA4P59901 499 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR5P61964 334 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HLXQ14774 488 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HEPACAMQ14CZ8 416 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF528Q3MIS6 628 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM74A1Q5RGS3 127 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 OR7E24Q6IFN5 339 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 SBSNQ6UWP8 590 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZTK2 550 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 FGD2Q7Z6J4 655 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NAGSQ8N159 534 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 DBF4BQ8NFT6 615 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6S1Q8NH40 331 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ARRDC2Q8TBH0 407 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM40Q8WWA1 233 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGKQ92643 395 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PSMG2Q969U7 264 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TADA1Q96BN2 335 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 APIPQ96GX9 242 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 CLUHP3Q96NS8 147 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ABHD1Q96SE0 405 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC00597Q9H2U6 94 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 NMUR1Q9HB89 426 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 ZFP57Q9NU63 452 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 TVP23BQ9NYZ1 205 aa7.9□□□□□ -1.14
RABGEF1-203ENST00000439720 PLSCR5A0PG75 271 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 DVL2O14641 736 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 YY2O15391 372 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 FGF10O15520 208 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RP2O75695 350 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 S100A9P06702 114 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 HMBSP08397 361 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 C1SP09871 688 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SPP1P10451 314 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TYMPP19971 482 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PVALBP20472 110 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 NFYAP23511 347 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 GABRA5P31644 462 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 IRS1P35568 1242 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 EIF1P41567 113 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CCL23P55773 120 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 WSCD1Q658N2 575 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MTFR2Q6P444 385 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SIAH3Q8IW03 269 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TOMM5Q8N4H5 51 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SAMD12Q8N8I0 201 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OR1M1Q8NGA1 313 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 C1orf216Q8TAB5 229 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SELENOMQ8WWX9 145 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PDE7BQ9NP56 450 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 FLVCR2Q9UPI3 526 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 DTX4Q9Y2E6 619 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TTC3P53804 2025 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ARPC5O15511 151 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 COX7A2P14406 83 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CBR1P16152 277 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 HLA-FP30511 346 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SCAND1P57086 179 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 LGALS3BPQ08380 585 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CHRNA6Q15825 494 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 UAP1L1Q3KQV9 507 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC36A2Q495M3 483 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CBLN2Q8IUK8 224 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 HUS1BQ8NHY5 278 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TCEAL3Q969E4 200 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CAMK1GQ96NX5 476 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 TMEM161AQ9NX61 479 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MGAT4CQ9UBM8 478 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 INSL6Q9Y581 213 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 NPTNQ9Y639 398 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MYO10Q9HD67 2058 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MCRIP1C9JLW8 97 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 MID1O15344 667 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 PRPS2P11908 318 aa7.89□□□□□ -1.15
RABGEF1-203ENST00000439720 CTPS1P17812 591 aa7.89□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms