RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429174.6

DYSF-211, Transcript of dysferlin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene DYSF, Length 6,739 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSF-211ENST00000429174 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.84□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.84□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 ZFP90Q8TF47 636 aa14.84□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 LIPT1Q9Y234 373 aa14.84□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 CHRNB1P11230 501 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 BMP1P13497 986 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 KCNE1P15382 129 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 M6PRP20645 277 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 ACTBP60709 375 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 ACTG1P63261 375 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 HOXC5Q00444 222 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 TLE3Q04726 772 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 UPP1Q16831 310 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 IL17RDQ8NFM7 739 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 OR4K5Q8NGD3 323 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 NT5C3BQ969T7 300 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa14.83□□□□□ -0.03
DYSF-211ENST00000429174 K7EPK0 472 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 SOCS5O75159 536 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 BCAS1O75363 584 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 RAB3DO95716 219 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 LCATP04180 440 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 MS4A2Q01362 244 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 GPR17Q13304 367 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 CDK5R2Q13319 367 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 C14orf28Q4W4Y0 310 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 PAGE3Q5JUK9 113 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 CPOQ8IVL8 374 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 PM20D2Q8IYS1 436 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 C19orf12Q9NSK7 152 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 HNF4GQ14541 408 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 SLX4IPQ5VYV7 408 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 DAZLQ92904 295 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 PAAF1Q9BRP4 392 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 SUCNR1Q9BXA5 334 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 FKRPQ9H9S5 495 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 APMAPQ9HDC9 416 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 OR6C65A6NJZ3 312 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 PRSS3P35030 304 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 CA14Q9ULX7 337 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 LILRB3O75022 631 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 CCL5P13501 91 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 OSMP13725 252 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 CERS1P27544 350 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 KBTBD6Q86V97 674 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 UEVLDQ8IX04 471 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 ST7LQ8TDW4 575 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 OR5B2Q96R09 309 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 MED16Q9Y2X0 877 aa14.83□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 RORAP35398 523 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 FOXA1P55317 472 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 CLDN8P56748 225 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 SLC16A5O15375 505 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 PTTG1O95997 202 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 COQ5Q5HYK3 327 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 OR52W1Q6IF63 320 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 WDTC1Q8N5D0 677 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 OR2A12Q8NGT7 310 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 OR2T4Q8NH00 348 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 IL1F10Q8WWZ1 152 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 SYT3Q9BQG1 590 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 KCNK13Q9HB14 408 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 FDXRP22570 491 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 CDK3Q00526 305 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 GAB1Q13480 694 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 SUMF2Q8NBJ7 301 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 B3GNT7Q8NFL0 401 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 TXNRD2Q9NNW7 524 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 TMEM181Q9P2C4 612 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 VDAC3Q9Y277 283 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 ITGB8P26012 769 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 LETMD1Q6P1Q0 360 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 SGPP2Q8IWX5 399 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 WDR92Q96MX6 357 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 STRADBQ9C0K7 418 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 RGNQ15493 299 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 ZNF461Q8TAF7 563 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 BRI3BPQ8WY22 251 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 THSD1Q9NS62 852 aa14.82□□□□□ -0.04
DYSF-211ENST00000429174 PPP1R14DQ9NXH3 145 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms