RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428445.1

VARS-216, Transcript of valyl-tRNA synthetase, humanhuman

TSL 5

Gene VARS, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VARS-216ENST00000428445 NID1P14543 1247 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 TAC1P20366 129 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 HMOX2P30519 316 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GSTM5P46439 218 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 SLC6A8P48029 635 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 KRT6CP48668 564 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 PCYT1AP49585 367 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 C2orf80Q0P641 193 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 RASA2Q15283 850 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 TIFABQ6ZNK6 161 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 FAM9CQ8IZT9 166 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 IFT81Q8WYA0 676 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 RNF122Q9H9V4 155 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 TAS2R9Q9NYW1 312 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 STK38LQ9Y2H1 464 aa14.88□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GXYLT2A0PJZ3 443 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 EMC8O43402 210 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 TNFRSF21O75509 655 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 MPIP34949 423 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 NR1H2P55055 460 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 FOXA1P55317 472 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 ACSM2AQ08AH3 577 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 HEPACAMQ14CZ8 416 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 ACSM2BQ68CK6 577 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 APOOLQ6UXV4 268 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GALNT10Q86SR1 603 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 FMO2Q99518 471 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 SLC39A3Q9BRY0 314 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 BDH2Q9BUT1 245 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GIMAP4Q9NUV9 329 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 ELOVL5Q9NYP7 299 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 ADAM21Q9UKJ8 722 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 PROCRQ9UNN8 238 aa14.87□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 SERTM1A2A2V5 107 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 CCDC151A5D8V7 595 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 MYO1GB0I1T2 1018 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 UPK1AO00322 258 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 IGKV1D-16P01601 117 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 FPR1P21462 350 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 TBXA2RP21731 343 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GCAP28676 217 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 PTH2RP49190 550 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GUSBP1Q15486 140 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 SGCBQ16585 318 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 SPDYAQ5MJ70 313 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 ZNF382Q96SR6 550 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 KLHDC3Q9BQ90 382 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GLIPR2Q9H4G4 154 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 SIRT5Q9NXA8 310 aa14.86□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 FAM171A2A8MVW0 826 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GOLGA8RI6L899 631 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 KLF4O43474 513 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 CD8BP10966 210 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 IMPDH1P20839 514 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 ECHS1P30084 290 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 NAA20P61599 178 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 SPIN4Q56A73 249 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GALNT18Q6P9A2 607 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 PRSS57Q6UWY2 283 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GGNQ86UU5 652 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 SLC22A9Q8IVM8 553 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 MNS1Q8NEH6 495 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 PIK3R3Q92569 461 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 SLC9A6Q92581 669 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 VDAC3Q9Y277 283 aa14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 MBD3L2BA0A1B0GVZ6 204 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 LINC01387J3KSC0 135 aa14.84□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 SLITRK5O94991 958 aa14.84□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 UTS2O95399 124 aa14.84□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 NTN1O95631 604 aa14.84□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 IL33O95760 270 aa14.84□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 DDCP20711 480 aa14.84□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 GABRA3P34903 492 aa14.84□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
VARS-216ENST00000428445 DECR1Q16698 335 aa14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.4 ms