RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 NGBQ9NPG2 151 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 KLHL21Q9UJP4 597 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ODF2LQ9ULJ1 636 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 USP6P35125 1406 aa3.07□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 FAM220BPB1ANY3 271 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 E7ENQ6 273 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PRPSAP2O60256 369 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TOM1L1O75674 476 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 STAM2O75886 525 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CA3P07451 260 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 P0C879 139 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CCNA2P20248 432 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 IL10P22301 178 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 NF2P35240 595 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CAMLGP49069 296 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 GMFBP60983 142 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CYP51A1Q16850 503 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ERASQ7Z444 233 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CERS5Q8N5B7 392 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CSNK1A1LQ8N752 337 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 BCORP1Q8N888 145 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 OR52B4Q8NGK2 314 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 OR13F1Q8NGS4 319 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 FAF2Q96CS3 445 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 DPH7Q9BTV6 452 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CECR2Q9BXF3 1484 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TEX13BQ9BXU2 312 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 GLT8D2Q9H1C3 349 aa3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 WASHC1A8K0Z3 465 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 WASH3PC4AMC7 463 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 RAMP1O60894 148 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CCDC166P0CW27 439 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZNF19P17023 458 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ASMTP46597 345 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 EMDP50402 254 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 LYZP61626 148 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CDKN3Q16667 212 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ADPRMQ3LIE5 342 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 WASH2PQ6VEQ5 465 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 EFCAB13Q8IY85 973 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CADM2Q8N3J6 435 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 BPIFB2Q8N4F0 458 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CNNM3Q8NE01 707 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 KCNK16Q96T55 309 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 KIR2DL4Q99706 377 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 NFKBIZQ9BYH8 718 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 EHFQ9NZC4 300 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 IL17CQ9P0M4 197 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ATP6V1HQ9UI12 483 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 FOXJ3Q9UPW0 622 aa3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 LATO43561 262 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 APBB3O95704 486 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PGK1P00558 417 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 DUX4L4P0CJ87 422 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PAICSP22234 425 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 DNAJB1P25685 340 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 RPL4P36578 427 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 NOVA1P51513 510 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 P2RY4P51582 365 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 MTTPP55157 894 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 RPS8P62241 208 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 OVGP1Q12889 678 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZNF79Q15937 498 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ISXQ2M1V0 245 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TMEM52BQ4KMG9 183 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PAGE2BQ5JRK9 111 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 STAC2Q6ZMT1 411 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 CYS1Q717R9 158 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 MISPQ8IVT2 679 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 GIPC3Q8TF64 312 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 SELENOMQ8WWX9 145 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 UPRTQ96BW1 309 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 SLC25A38Q96DW6 304 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 VSTM2LQ96N03 204 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 ZIM3Q96PE6 472 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TMEM121Q9BTD3 319 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 TBCDQ9BTW9 1192 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 COMMD4Q9H0A8 199 aa3.04□□□□□ -1.92
RBM39-211ENST00000426951 SLC25A51Q9H1U9 297 aa3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms