RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 Q6YL49 198 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 RNF44Q7L0R7 432 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD46Q86W74 232 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 PAQR7Q86WK9 346 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 IFNEQ86WN2 208 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 OOSP2Q86WS3 158 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 NRROSQ86YC3 692 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SLC30A8Q8IWU4 369 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ANKFN1Q8N957 763 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ICA1LQ8NDH6 482 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ZNF740Q8NDX6 193 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 BEND2Q8NDZ0 799 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 OR2L5Q8NG80 312 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 OR7A2PQ8NGA2 310 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 OR4A15Q8NGL6 344 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 IFI44Q8TCB0 444 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 NT5CQ8TCD5 201 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CREB3L4Q8TEY5 395 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 C16orf78Q8WTQ4 265 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CANT1Q8WVQ1 401 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 NCLNQ969V3 563 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 RGMAQ96B86 450 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SLCO4A1Q96BD0 722 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 EGLN2Q96KS0 407 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ZNF583Q96ND8 569 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 PRAP1Q96NZ9 151 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 LRRC61Q9BV99 259 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 UGT2B28Q9BY64 529 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ABCG4Q9H172 646 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 IKZF5Q9H5V7 419 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 XKR8Q9H6D3 395 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 UCK1Q9HA47 277 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CPNE7Q9UBL6 633 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 EDARQ9UNE0 448 aa6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CCDC187A0A096LP49 1063 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 A0A0J9YY10 115 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 LRIT2A6NDA9 550 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 OR5K3A6NET4 321 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 URADA6NGE7 173 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 GABRR3A8MPY1 467 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ISM1B1AKI9 464 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CLIC1O00299 241 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 BTN3A3O00478 584 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ZW10O43264 779 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 KRT75O95678 551 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 EML2O95834 649 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 NUDT3O95989 172 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CSF2P04141 144 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 LPLP06858 475 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 KLK1P06870 262 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 RAP2AP10114 183 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 LIPCP11150 499 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CTSEP14091 401 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 UGT2B7P16662 529 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CPEP16870 476 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 NTSP30990 170 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 PCGF2P35227 344 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 FRKP42685 505 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CAPZBP47756 277 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 GZMKP49863 264 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 GZMMP51124 257 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 AQP4P55087 323 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SCAND1P57086 179 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TAS2R50P59544 299 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 RBBP4Q09028 425 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 BIRC2Q13490 618 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 VEZF1Q14119 521 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 GLYATQ6IB77 296 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 KLHL35Q6PF15 583 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SPESP1Q6UW49 350 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ASPGQ86U10 573 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 GKN2Q86XP6 184 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CLECL1Q8IZS7 167 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 C2orf73Q8N5S3 287 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 FAM47BQ8NA70 645 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 OR10A6Q8NH74 314 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
CCL20-202ENST00000409189 SLC37A2Q8TED4 501 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms