RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 WDR54Q9H977 334 aa9.1□□□□□ -0.95
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POLR1A-202ENST00000409024 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 TENM4Q6N022 2769 aa9.1□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
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POLR1A-202ENST00000409024 C17orf105B2RV13 164 aa9.09□□□□□ -0.95
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POLR1A-202ENST00000409024 IGKV3-11P04433 115 aa9.09□□□□□ -0.95
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POLR1A-202ENST00000409024 PIGAP37287 484 aa9.09□□□□□ -0.95
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POLR1A-202ENST00000409024 MFSD4BQ5TF39 518 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 TCTN3Q6NUS6 607 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 TBPL2Q6SJ96 375 aa9.09□□□□□ -0.95
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POLR1A-202ENST00000409024 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.09□□□□□ -0.95
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POLR1A-202ENST00000409024 ZDHHC19Q8WVZ1 309 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
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POLR1A-202ENST00000409024 CTRCQ99895 268 aa9.09□□□□□ -0.95
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POLR1A-202ENST00000409024 B3GNT4Q9C0J1 378 aa9.09□□□□□ -0.95
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POLR1A-202ENST00000409024 ACER3Q9NUN7 267 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 COPS7AQ9UBW8 275 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 MKL2Q9ULH7 1088 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 TMCC3Q9ULS5 477 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 CBLCQ9ULV8 474 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 ERVK-19Q9WJR5 959 aa9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF443Q9Y2A4 671 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP9.09□□□□□ -0.95
POLR1A-202ENST00000409024 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.09□□□□□ -0.95
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POLR1A-202ENST00000409024 NUP210LQ5VU65 1888 aa9.08□□□□□ -0.96
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POLR1A-202ENST00000409024 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.08□□□□□ -0.96
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POLR1A-202ENST00000409024 MEN1O00255 615 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 FAAHO00519 579 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 TO15178 435 aa9.08□□□□□ -0.96
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POLR1A-202ENST00000409024 DDAH2O95865 285 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 HEXBP07686 556 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
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POLR1A-202ENST00000409024 SSTR4P31391 388 aa9.08□□□□□ -0.96
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POLR1A-202ENST00000409024 OR1E2P47887 323 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 ST3GAL3Q11203 375 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 DECR1Q16698 335 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 VWA2Q5GFL6 755 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 DCST1Q5T197 706 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 C6orf52Q5T4I8 152 aa9.08□□□□□ -0.96
POLR1A-202ENST00000409024 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa9.08□□□□□ -0.96
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