RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 ALAS2P22557 587 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 SIGIRRQ6IA17 410 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4F3Q6IEY1 312 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf94Q6P1W5 598 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 LRRTM4Q86VH4 590 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 LYSMD2Q8IV50 215 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 LRIT2A6NDA9 550 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 A6NL46 340 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 FMO6PO60774 539 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 CAPNS1P04632 268 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 GCSHP23434 173 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM124AQ86V42 546 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC2A13Q96QE2 648 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 OLAHQ9NV23 265 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM96BQ9Y3D0 163 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 NME4O00746 187 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 YKT6O15498 198 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC1A3P43003 542 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 ZFP82Q8N141 532 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 TRMT61BQ9BVS5 477 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 NUDT9Q9BW91 350 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC25A32Q9H2D1 315 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 AIG1Q9NVV5 245 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 DEC1Q9P2X7 70 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 APOFQ13790 326 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 KLK4Q9Y5K2 254 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 C2orf72A6NCS6 295 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 CNR1P21554 472 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 GIPRP48546 466 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP10.1□□□□□ -0.796e-7■■■■□ 20.2
SH3BP2-201ENST00000356331 FLYWCH1Q4VC44 716 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 PLA2G15Q8NCC3 412 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 GLYATL2Q8WU03 294 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf74Q96LT6 269 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 MYADMQ96S97 322 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 A0A1B0GV50 99 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC22A23A1A5C7 686 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 PLGP00747 810 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 ADH7P40394 386 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 TMEM150AQ86TG1 271 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 NHLRC2Q8NBF2 726 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 PPP1R35Q8TAP8 253 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 ESAMQ96AP7 390 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 CHRDL1Q9BU40 450 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 PCED1AQ9H1Q7 454 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 NIT2Q9NQR4 276 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 KPTNQ9Y664 436 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 OSMP13725 252 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 AGXTP21549 392 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 DRD5P21918 477 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 MPEG1Q2M385 716 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM205BPQ63HN1 556 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 C5orf46Q6UWT4 87 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 SERINC5Q86VE9 423 aa10.1□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 KLK1P06870 262 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 PTNP21246 168 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC6A8P48029 635 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 PLA2G7Q13093 441 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 ENTHD1Q8IYW4 607 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4Q3Q8NH05 313 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 SLC25A36Q96CQ1 311 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 NCDNQ9UBB6 729 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 AMY2AP04746 511 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 ETV4P43268 484 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 DIO3P55073 304 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 BEX3Q00994 111 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 GALNT2Q10471 571 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 STEAP4Q687X5 459 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 GPC2Q8N158 579 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 OR4M1Q8NGD0 313 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 WDR45Q9Y484 360 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 ZNF850A8MQ14 1090 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 RFXAPO00287 272 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 MT-ND4LP03901 98 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 C6orf136Q5SQH8 315 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 CD276Q5ZPR3 534 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa10.09□□□□□ -0.79
SH3BP2-201ENST00000356331 RGL4Q8IZJ4 473 aa10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms