RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298564.14

TSPAN17-201, Transcript of tetraspanin 17, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TSPAN17, Length 2,810 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17-201ENST00000298564 MACROD1Q9BQ69 325 aa16.69■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 SAP130Q9H0E3 1048 aa16.69■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 PCBD2Q9H0N5 130 aa16.69■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 WDR26Q9H7D7 661 aa16.69■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 A4GNTQ9UNA3 340 aa16.69■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 KCNK6Q9Y257 313 aa16.69■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 A0A1W2PP55 124 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 ZC3H12DA2A288 527 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM183AA6NL82 134 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 A8MVJ9 347 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 SLC2A10O95528 541 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 ATP6V1E1P36543 226 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 CSNK1G2P78368 415 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM201Q5SNT2 666 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 QSOX2Q6ZRP7 698 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 HDDC3Q8N4P3 179 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 ANGPTL6Q8NI99 470 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 RGMAQ96B86 450 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 TEX101Q9BY14 249 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 CDH10Q9Y6N8 788 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 HMGN4O00479 90 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 LGI1O95970 557 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 MTNR1AP48039 350 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 BNC1Q01954 994 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 FGL2Q14314 439 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 IRF4Q15306 451 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 KLHL22Q53GT1 634 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 BPHLQ86WA6 291 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 KLBQ86Z14 1044 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 AP3S1Q92572 193 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 C17orf62Q9BQA9 187 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 PLA2G2FQ9BZM2 168 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 NEUROD4Q9HD90 331 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 A4GALTQ9NPC4 353 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 NUDT15Q9NV35 164 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 ZSCAN32Q9NX65 697 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 WBP1LQ9NX94 342 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 NTNG1Q9Y2I2 539 aa16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP16.68■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 FAAHO00519 579 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 SCAMP1O15126 338 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 CCT3P49368 545 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 GAS1P54826 345 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 PPP3R1P63098 170 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 TJAP1Q5JTD0 557 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 CREB3L2Q70SY1 520 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 OR8D4Q8NGM9 314 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 MARVELD1Q9BSK0 173 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 RNF32Q9H0A6 362 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 SERHL2Q9H4I8 314 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 GLTPQ9NZD2 209 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 C2orf16Q68DN1 1984 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 GABRPO00591 440 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 SEC14L5O43304 696 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 UBL4AP11441 157 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 PKLRP30613 574 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 FAM26EQ8N5C1 309 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 DUSP18Q8NEJ0 188 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 OR11H7Q8NGC8 314 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM163Q8TC26 289 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 LRRC20Q8TCA0 184 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM106CQ9BVX2 250 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 NIPAL2Q9H841 368 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 KCNN3Q9UGI6 736 aa16.67■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 DENND4AQ7Z401 1863 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 CDK2AP1O14519 115 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 OCLNQ16625 522 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 CDONQ4KMG0 1287 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 OR4C11Q6IEV9 310 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 TMEM91Q6ZNR0 172 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 DPH7Q9BTV6 452 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 AICDAQ9GZX7 198 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 ABCG5Q9H222 651 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 ACSL5Q9ULC5 683 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 NCKAP1Q9Y2A7 1128 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 TBX19O60806 448 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 FRKP42685 505 aaPredicted RBP16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 OR10A3P58181 314 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 C2orf27AQ580R0 203 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 ZBTB37Q5TC79 503 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 C7orf61Q8IZ16 206 aa16.66■□□□□ 0.26
TSPAN17-201ENST00000298564 ANKK1Q8NFD2 765 aa16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55 ms