RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298527.10

CLEC1B-201, Transcript of C-type lectin domain family 1 member B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLEC1B, Length 952 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC1B-201ENST00000298527 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 METTL4Q8N3J2 472 aa14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 OR6K3Q8NGY3 331 aa14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 FRG2BQ96QU4 278 aa14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 C19orf24Q9BVV8 132 aa14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 BEX2Q9BXY8 128 aa14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC12A4Q9UP95 1085 aa14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 EMC9Q9Y3B6 208 aa14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 ANK2Q01484 3957 aa14.48□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 ADAM11O75078 769 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 ESRRBO95718 433 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 PLGP00747 810 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 THBS1P07996 1170 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 SOD3P08294 240 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 DANCRP0C864 163 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 CT45A8P0DMV1 189 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 CT45A9P0DMV2 189 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 PNLIPRP2P54317 469 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 GAS1P54826 345 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 PSPHP78330 225 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 IFT88Q13099 833 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 FAM83EQ2M2I3 478 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 CT45A2Q5DJT8 189 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 LRIG3Q6UXM1 1119 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 CCDC116Q8IYX3 515 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 OR2M3Q8NG83 312 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 TRPC4APQ8TEL6 797 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 KAT2AQ92830 837 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 BTBD9Q96Q07 612 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 TACO1Q9BSH4 297 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 ACTR6Q9GZN1 396 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 MED11Q9P086 117 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 UTS2RQ9UKP6 389 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 LIPT1Q9Y234 373 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 OR10H1Q9Y4A9 318 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 RNF115Q9Y4L5 304 aa14.47□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 OR2M5A3KFT3 312 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 AQP8O94778 261 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 IGHV4-39P01824 125 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 CDKN1AP38936 164 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 CTBP2P56545 445 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 GANABQ14697 944 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF628Q5EBL2 1059 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 KLC3Q6P597 504 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 BEND4Q6ZU67 534 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 CYS1Q717R9 158 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 FADS6Q8N9I5 356 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 OR4N2Q8NGD1 307 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 HS6ST2Q96MM7 605 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF681Q96N22 645 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 ZIM3Q96PE6 472 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 RHNO1Q9BSD3 238 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 LRTM1Q9HBL6 345 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 GPR52Q9Y2T5 361 aa14.46□□□□□ -0.09
CLEC1B-201ENST00000298527 C2P06681 752 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 FESP07332 822 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 IL11P20809 199 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 EVI2BP34910 448 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 SLC29A2Q14542 456 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 ACAP2Q15057 778 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 METTL25Q8N6Q8 603 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 OR9A2Q8NGT5 310 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 ZNF675Q8TD23 568 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 RNF138Q8WVD3 245 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 PHF21BQ96EK2 531 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 VSTM2LQ96N03 204 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 KCNK17Q96T54 332 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 FOLH1BQ9HBA9 442 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.45□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 A0A1W2PP18 115 aa14.44□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 CLOCKO15516 846 aa14.44□□□□□ -0.1
CLEC1B-201ENST00000298527 GMFGO60234 142 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.9 ms