RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281821.6

EPHA4-201, Transcript of EPH receptor A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EPHA4, Length 6,346 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4-201ENST00000281821 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.26□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 ACAD8Q9UKU7 415 aa7.26□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa7.26□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 EFCAB10A6NFE3 127 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 FTCDNL1E5RQL4 147 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 KLK10O43240 276 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 HLA-DQA2P01906 255 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 SLC15A1P46059 708 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 TMPRSS3P57727 454 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 GID4Q8IVV7 300 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 IPCEF1Q8WWN9 437 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF501Q96CX3 271 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 PRRC1Q96M27 445 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 LMF1Q96S06 567 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 CDADC1Q9BWV3 514 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 GPR83Q9NYM4 423 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 FBXL3Q9UKT7 428 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 MYRFQ9Y2G1 1151 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 CD2P06729 351 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 GUSBP08236 651 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 DCTP40126 519 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 CDK9P50750 372 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 FOXA1P55317 472 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 DAG1Q14118 895 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 PAMR1Q6UXH9 720 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 PMEPA1Q969W9 287 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 IFT27Q9BW83 186 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 SLC26A1Q9H2B4 701 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 SLC7A8Q9UHI5 535 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 BCL10O95999 233 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 STATHP02808 62 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 DAP3P51398 398 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 ACTC1P68032 377 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 ACTA1P68133 377 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 PON3Q15166 354 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 SNAPC1Q16533 368 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 UGT8Q16880 541 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 OR2A2Q6IF42 318 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 ZNF613Q6PF04 617 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 RAB8BQ92930 207 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 ARL5BQ96KC2 179 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 GPR160Q9UJ42 338 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 RAB26Q9ULW5 256 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 EMC9Q9Y3B6 208 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 PATE3B3GLJ2 98 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 PRRG2O14669 202 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 ABOP16442 354 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 CCNA2P20248 432 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 CAPN3P20807 821 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 CAPZA1P52907 286 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 SELENOWP63302 87 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 C16orf72Q14CZ0 275 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 TMEM225Q6GV28 225 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 KCTD18Q6PI47 426 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 ALPK1Q96QP1 1244 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 GLIPR2Q9H4G4 154 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 TCFL5Q9UL49 500 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 A0A1W2PR48 441 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 GXYLT2A0PJZ3 443 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 H0YC42 278 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 MT-ND5P03915 603 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 ANPEPP15144 967 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 IDUAP35475 653 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 RBM34P42696 430 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 MPEG1Q2M385 716 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 GRINAQ7Z429 371 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 PELI3Q8N2H9 469 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 OR7D2Q96RA2 312 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 S100A13Q99584 98 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 NANSQ9NR45 359 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 OLAHQ9NV23 265 aa7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.24□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 FAM20BO75063 409 aa7.24□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 PRR35P0CG20 571 aa7.24□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 IFI30P13284 250 aa7.24□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 CPOXP36551 454 aa7.24□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 HYAL2Q12891 473 aa7.24□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 TMEM211Q6ICI0 200 aa7.24□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 SLC25A25Q6KCM7 469 aa7.24□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 THAP5Q7Z6K1 395 aa7.24□□□□□ -1.25
EPHA4-201ENST00000281821 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.1 ms