RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264244.7

TIMMDC1-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMMDC1, Length 1,271 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-201ENST00000264244 GPR22Q99680 433 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMMDC1-201ENST00000264244 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
TIMMDC1-201ENST00000264244 C12orf49Q9H741 205 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMMDC1-201ENST00000264244 PTGES2Q9H7Z7 377 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMMDC1-201ENST00000264244 MANSC1Q9H8J5 431 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMMDC1-201ENST00000264244 GLRX2Q9NS18 164 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAIMQ9NVQ4 179 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMMDC1-201ENST00000264244 FBXO34Q9NWN3 711 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMMDC1-201ENST00000264244 ADAM29Q9UKF5 820 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMMDC1-201ENST00000264244 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMMDC1-201ENST00000264244 SNX8Q9Y5X2 465 aa11.03□□□□□ -0.64
TIMMDC1-201ENST00000264244 ALPK2Q86TB3 2170 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 SHISA9B4DS77 424 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 SHISA8B8ZZ34 492 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 NTN1O95631 604 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 CTAGE8P0CG41 777 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 CFPP27918 469 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 AGTR1P30556 359 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 MAPK12P53778 367 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 C21orf58P58505 322 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 RAB10P61026 200 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 STX5Q13190 355 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF628Q5EBL2 1059 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 SFRP5Q5T4F7 317 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 CTAGE4Q8IX94 777 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 L3MBTL4Q8NA19 623 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPC24Q8NBT2 197 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRPC4APQ8TEL6 797 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 DUSP19Q8WTR2 217 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 HTRA1Q92743 480 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 KLHL29Q96CT2 875 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 HBEGFQ99075 208 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 CACNG6Q9BXT2 260 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 CHODLQ9H9P2 273 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 L2HGDHQ9H9P8 463 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 SDHAF3Q9NRP4 125 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 FLRT3Q9NZU0 649 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 XPR1Q9UBH6 696 aa11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 TGP01266 2768 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 TUBBP07437 444 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 IL32P24001 234 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 ARL4CP56559 192 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 PSPHP78330 225 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 IRF9Q00978 393 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 PDIA2Q13087 525 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 LGSNQ5TDP6 509 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 AGAP6Q5VW22 663 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 C11orf71Q6IPW1 123 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 PAGE2Q7Z2X7 111 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 GALNT10Q86SR1 603 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 EXOC3L1Q86VI1 746 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 METTL4Q8N3J2 472 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF675Q8TD23 568 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 C10orf105Q8TEF2 133 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM168AQ92567 244 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 TM4SF18Q96CE8 201 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 ADGRG7Q96K78 797 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 RBBP8Q99708 897 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 IPPKQ9H8X2 491 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 AHSPQ9NZD4 102 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 PSME2Q9UL46 239 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 KCNS2Q9ULS6 477 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 ACOT9Q9Y305 439 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa11.01□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 ADAMDEC1O15204 470 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 TP73O15350 636 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 CXCL13O43927 109 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 GUCY1B2O75343 617 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 CLDN9O95484 217 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 USF1P22415 310 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 CDH11P55287 796 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 GTF2H2Q13888 395 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 SQLEQ14534 574 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 PFKFB4Q16877 469 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM166AQ6J272 317 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 TFAP2EQ6VUC0 442 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 COMMD6Q7Z4G1 85 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 MARCH3Q86UD3 253 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 CCDC116Q8IYX3 515 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 ACTRT1Q8TDG2 376 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 PROX1Q92786 737 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 KAT2AQ92830 837 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 ERP27Q96DN0 273 aa11□□□□□ -0.65
TIMMDC1-201ENST00000264244 C1orf159Q96HA4 380 aa11□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms