RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 KLHL28Q9NXS3 571 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF226Q9NYT6 803 aa22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 FADS1O60427 444 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 DLX3O60479 287 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 HMOX2P30519 316 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 MEIOBQ8N635 442 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 FIG4Q92562 907 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 PIGTQ969N2 578 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ARSGQ96EG1 525 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 FAM111AQ96PZ2 611 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF395Q9H8N7 513 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM216Q9P0N5 145 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 SENP1Q9P0U3 644 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 NFU1Q9UMS0 254 aa22.49■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 SCO2O43819 266 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 SMPD2O60906 423 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 HEXAP06865 529 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 IMPDH1P20839 514 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 CRYGSP22914 178 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 Q5PR19 223 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 RAET1LQ5VY80 246 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 P3H2Q8IVL5 708 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 IFT81Q8WYA0 676 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 BBS4Q96RK4 519 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 MED18Q9BUE0 208 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 SIRT5Q9NXA8 310 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ELOVL5Q9NYP7 299 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF337Q9Y3M9 751 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 TLN2Q9Y4G6 2542 aa22.48■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ZANQ9Y493 2812 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 A0A087WV62 115 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 FAM171A2A8MVW0 826 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 MYO1GB0I1T2 1018 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 H0YC42 278 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 COQ9O75208 318 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 TNFRSF21O75509 655 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 HK1P19367 917 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ECHS1P30084 290 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 UGT2B10P36537 528 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 GSTM5P46439 218 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
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PTPRF-216ENST00000617451 CYP27C1Q4G0S4 372 aa22.47■■□□□ 1.19
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PTPRF-216ENST00000617451 SLC39A3Q9BRY0 314 aa22.47■■□□□ 1.19
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PTPRF-216ENST00000617451 RNF122Q9H9V4 155 aa22.47■■□□□ 1.19
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PTPRF-216ENST00000617451 MED11Q9P086 117 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ABCG2Q9UNQ0 655 aa22.47■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 LINC01387J3KSC0 135 aa22.46■■□□□ 1.19
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PTPRF-216ENST00000617451 LCP2Q13094 533 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ACKR1Q16570 336 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 SH2D4BQ5SQS7 431 aa22.46■■□□□ 1.19
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PTPRF-216ENST00000617451 PIK3IP1Q96FE7 263 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 COX4I2Q96KJ9 171 aa22.46■■□□□ 1.19
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PTPRF-216ENST00000617451 RTN4RQ9BZR6 473 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 FLRT3Q9NZU0 649 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 STK38LQ9Y2H1 464 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF175Q9Y473 711 aa22.46■■□□□ 1.19
PTPRF-216ENST00000617451 TIMM22Q9Y584 194 aa22.46■■□□□ 1.19
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PTPRF-216ENST00000617451 OR2M5A3KFT3 312 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 SLITRK5O94991 958 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 CD8BP10966 210 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 POU2F1P14859 743 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 PRKAA2P54646 552 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 PKNOX1P55347 436 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 SIRPAP78324 504 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 PRSS57Q6UWY2 283 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 LCA5Q86VQ0 697 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 OR5M1Q8NGP8 315 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 FNDC9Q8TBE3 224 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 L3HYPDHQ96EM0 354 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 MARK4Q96L34 752 aa22.45■■□□□ 1.18
PTPRF-216ENST00000617451 KCNA7Q96RP8 456 aa22.45■■□□□ 1.18
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