RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 BTNL2Q9UIR0 455 aa20.22■□□□□ 0.83
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PTPRM-211ENST00000580170 A0A0U1RQS6 177 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 A6NJ64 397 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 DUX1O43812 170 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 CAPNS1P04632 268 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 POU3F4P49335 361 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRM-211ENST00000580170 FIGLAQ6QHK4 219 aa20.21■□□□□ 0.83
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PTPRM-211ENST00000580170 CTXN1P60606 82 aa20.21■□□□□ 0.83
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PTPRM-211ENST00000580170 TRIM46Q7Z4K8 759 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 OR5AR1Q8NGP9 310 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 DDIT4LQ96D03 193 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 IL26Q9NPH9 171 aa20.19■□□□□ 0.82
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV18A0A075B6X5 111 aa20.19■□□□□ 0.82
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