RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577426.1

TRAPPC8-202, Transcript of trafficking protein particle complex 8, humanhuman

TSL 5

Gene TRAPPC8, Length 437 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM166BA8MTA8 275 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 C17orf105B2RV13 164 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SUPT3HB4E1H0 165 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 RTCAO00442 366 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PLPP1O14494 284 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 FGF17O60258 216 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SUPT3HO75486 399 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PDE9AO76083 593 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TOXO94900 526 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 IGKV3-11P04433 115 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 INHBAP08476 426 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCL3P10147 92 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PCNAP12004 261 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OSMP13725 252 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TNNI3P19429 210 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CPN2P22792 545 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CTSSP25774 331 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CNTFP26441 200 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CRABP2P29373 138 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PIK3CBP42338 1070 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SSR2P43308 183 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLCO1A2P46721 670 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 MTNR1BP49286 362 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SERPINB9P50453 376 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ARFIP1P53367 373 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 NUP107P57740 925 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAGOHP61326 146 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TNFRSF17Q02223 184 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PLGLB1Q02325 96 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ID2Q02363 134 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TLE4Q04727 773 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 FOXO1Q12778 655 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLAMF1Q13291 335 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 BIKQ13323 160 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ACAP2Q15057 778 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 AP5B1Q2VPB7 878 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF750Q32MQ0 723 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PIGGQ5H8A4 983 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 DEPDC1Q5TB30 811 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR4C11Q6IEV9 310 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 GRHL2Q6ISB3 625 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OPN5Q6U736 354 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 MEX3BQ6ZN04 569 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 DGAT2L6Q6ZPD8 337 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 RAPH1Q70E73 1250 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRILQ7L0X0 811 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CCDC91Q7Z6B0 441 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CMC1Q7Z7K0 106 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TRABD2AQ86V40 505 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SLC22A16Q86VW1 577 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CTAGE3PQ8IX95 158 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 C9orf40Q8IXQ3 194 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZCCHC7Q8N3Z6 543 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM109AQ8N4B1 249 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 RNF175Q8N4F7 328 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 RPRMLQ8N4K4 120 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TMEM251Q8N6I4 163 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PPM1NQ8N819 430 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR5M3Q8NGP4 307 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 LILRB4Q8NHJ6 448 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 HUS1BQ8NHY5 278 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 RHEBL1Q8TAI7 183 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 NUBPLQ8TB37 319 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TSPEARQ8WU66 669 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SNX33Q8WV41 574 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ASB5Q8WWX0 329 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 RND1Q92730 232 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 EXT2Q93063 718 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 RGMAQ96B86 450 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 NXNL1Q96CM4 212 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ARSGQ96EG1 525 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 FBXL20Q96IG2 436 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 DGAT2Q96PD7 388 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 FAM173AQ9BQD7 235 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR8D2Q9GZM6 311 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OR51B5Q9H339 312 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 RPF2Q9H7B2 306 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 IL1RL2Q9HB29 575 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 MCCC2Q9HCC0 563 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 SH2D2AQ9NP31 389 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 DMRT3Q9NQL9 472 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PNPLA3Q9NST1 481 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 MS4A12Q9NXJ0 267 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 OPTCQ9UBM4 332 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 COPS7AQ9UBW8 275 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 PHF11Q9UIL8 331 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 ATG4BQ9Y4P1 393 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 LIPGQ9Y5X9 500 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
TRAPPC8-202ENST00000577426 DOCK7Q96N67 2140 aa4.63□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.2 ms