RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000570139.1

CNOT1-222, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 1, human

TSL 2

Gene CNOT1, Length 458 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT1-222	ENST00000570139	LYPLA1	O75608	230 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	NDUFB4	O95168	129 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	IDS	P22304	550 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	SLC6A12	P48065	614 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	MNAT1	P51948	309 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	CCNG1	P51959	295 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	THOP1	P52888	689 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	INHBC	P55103	352 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	PFN3	P60673	137 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	DMTN	Q08495	405 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	SIGLEC14	Q08ET2	396 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	GTF2H2	Q13888	395 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	GGTA1P	Q4G0N0	100 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	GLIPR1L2	Q4G1C9	344 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	CES4A	Q5XG92	561 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	EPGN	Q6UW88	154 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	TRIL	Q7L0X0	811 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	SFTPA2	Q8IWL1	248 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	TIGD4	Q8IY51	512 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	CFAP206	Q8IYR0	622 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	LSMEM2	Q8N112	164 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF619	Q8N2I2	560 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	AGAP11	Q8TF27	550 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	RAD51AP1	Q96B01	352 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	RITA1	Q96K30	269 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	RILP	Q96NA2	401 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	OR2M4	Q96R27	311 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	BDH2	Q9BUT1	245 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	NTMT1	Q9BV86	223 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	C20orf27	Q9GZN8	174 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	OR52A5	Q9H2C5	316 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	PIGM	Q9H3S5	423 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	KCNK13	Q9HB14	408 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	CHMP1A	Q9HD42	196 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	TCF7L2	Q9NQB0	619 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	SAR1A	Q9NR31	198 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	BRWD1	Q9NSI6	2320 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	MARCO	Q9UEW3	520 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	PDE10A	Q9Y233	779 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139		A0A0C4DFX4	3053 aa		6.63	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	TRPM6	Q9BX84	2022 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV1OR15-9	A0A0B4J2B8	117 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	PRR23A	A6NEV1	266 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	ERICH4	A6NGS2	130 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	NCF1B	A6NI72	391 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	NCF1C	A8MVU1	366 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	ARHGEF33	A8MVX0	844 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	HSPB6	O14558	160 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	ZNF195	O14628	629 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	C1orf105	O95561	183 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	GUCA1C	O95843	209 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	WNT1	P04628	370 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	IGHV4-34	P06331	123 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	CHRNG	P07510	517 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	DDX5	P17844	614 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	CD27	P26842	260 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	PBLD	P30039	288 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	MAT2A	P31153	395 aa	Known RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	ARRB2	P32121	409 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	CDH13	P55290	713 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	ZXDA	P98168	799 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	RBPJ	Q06330	500 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	IFT88	Q13099	833 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	MAD2L1	Q13257	205 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	RBBP7	Q16576	425 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	PHKG1	Q16816	387 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	LACTB2	Q53H82	288 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	PYCR3	Q53H96	274 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	ENTPD8	Q5MY95	495 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	C6orf136	Q5SQH8	315 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	LIPJ	Q5W064	366 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	GGNBP1	Q5YKI7	109 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST2H2BC	Q6DN03	193 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	RAB12	Q6IQ22	244 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	DOK6	Q6PKX4	331 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	TBC1D21	Q8IYX1	336 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	PELI3	Q8N2H9	469 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	OR5K2	Q8NHB8	316 aa		6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	OSR1	Q8TAX0	266 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	DVL3	Q92997	716 aa	Predicted RBP	6.62	□□□□□ -1.35
CNOT1-222	ENST00000570139	C19orf60	Q96EN9	201 aa		6.62	□□□□□ -1.35

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