RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530405.5

PACSIN3-206, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 3

Gene PACSIN3, Length 563 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-206ENST00000530405 PTGES2Q9H7Z7 377 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 LPAR3Q9UBY5 353 aa14.61□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 PCNX3Q9H6A9 2034 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 A0A1W2PP18 115 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 CCDC189A1A4V9 331 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 CLOCKO15516 846 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 CLDN9O95484 217 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 CD3EP07766 207 aa14.6□□□□□ -0.07
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PACSIN3-206ENST00000530405 SLC6A8P48029 635 aa14.6□□□□□ -0.07
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PACSIN3-206ENST00000530405 PFKFB4Q16877 469 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
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PACSIN3-206ENST00000530405 NPSR1Q6W5P4 371 aa14.6□□□□□ -0.07
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PACSIN3-206ENST00000530405 FRG2BQ96QU4 278 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 PRRG4Q9BZD6 226 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 GRIP2Q9C0E4 1043 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 ESRP2Q9H6T0 727 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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PACSIN3-206ENST00000530405 MED11Q9P086 117 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 SNX8Q9Y5X2 465 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa14.6□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 YLPM1P49750 1951 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
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PACSIN3-206ENST00000530405 FADS1O60427 444 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 NDUFS7O75251 213 aa14.59□□□□□ -0.07
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PACSIN3-206ENST00000530405 GFAPP14136 432 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 CRABP2P29373 138 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 SPRP35270 261 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 CTU2Q2VPK5 515 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 TMEM249Q2WGJ8 235 aa14.59□□□□□ -0.07
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PACSIN3-206ENST00000530405 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 CMC1Q7Z7K0 106 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 GGNQ86UU5 652 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 TM4SF18Q96CE8 201 aa14.59□□□□□ -0.07
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PACSIN3-206ENST00000530405 C1GALT1C1Q96EU7 318 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 KCNK17Q96T54 332 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 NTMT1Q9BV86 223 aa14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 HDHD5Q9BXW7 423 aa14.59□□□□□ -0.07
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PACSIN3-206ENST00000530405 GLRX2Q9NS18 164 aa14.59□□□□□ -0.07
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PACSIN3-206ENST00000530405 CLEC4AQ9UMR7 237 aa14.59□□□□□ -0.07
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PACSIN3-206ENST00000530405 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM159BA6NKW6 160 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 VLDLRP98155 873 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 DR1Q01658 176 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 FAPQ12884 760 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 NRF1Q16656 503 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 GRTP1Q5TC63 336 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 ALKBH2Q6NS38 261 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 FAM180BQ6P0A1 224 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 OR10H5Q8NGA6 315 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 OR52B6Q8NGF0 335 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 NEUROG1Q92886 237 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 S100PBPQ96BU1 408 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 CDK15Q96Q40 435 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 FAIM2Q9BWQ8 316 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 ANKRA2Q9H9E1 313 aa14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 OR7A17O14581 309 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 NME6O75414 186 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 CD8AP01732 235 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 TMEM44Q2T9K0 475 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 PPP4R4Q6NUP7 873 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 DTX2Q86UW9 622 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 EXOC3L1Q86VI1 746 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 OR4N2Q8NGD1 307 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 TRIM2Q9C040 744 aa14.57□□□□□ -0.08
PACSIN3-206ENST00000530405 SHARPINQ9H0F6 387 aa14.57□□□□□ -0.08
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