RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529677.1

PACS1-208, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene PACS1, Length 679 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-208ENST00000529677 CALHM3Q86XJ0 350 aa15.53■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 SLC15A3Q8IY34 581 aa15.53■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 HORMAD2Q8N7B1 307 aa15.53■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.53■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 MFRPQ9BY79 579 aa15.53■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 DEFB126Q9BYW3 111 aa15.53■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 EQTNQ9NQ60 294 aa15.53■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 CMTM6Q9NX76 183 aa15.53■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 TMEM181Q9P2C4 612 aa15.53■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 DOCK10Q96BY6 2186 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 NAV3Q8IVL0 2385 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 FRG2CA6NGY1 282 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 ARGFXA6NJG6 315 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 DUXAA6NLW8 204 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 MASP2O00187 686 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 HMGN4O00479 90 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 ACOX3O15254 700 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 NME6O75414 186 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 AGR2O95994 175 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 SOX11P35716 441 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 RPS26P62854 115 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 ZNHIT3Q15649 155 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 DUSP5Q16690 384 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP15.52■□□□□ 0.083e-10■■■□□ 16.4
PACS1-208ENST00000529677 AP1ARQ63HQ0 302 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 SERPINA11Q86U17 422 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 C10orf111Q8N326 155 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 SLC16A11Q8NCK7 471 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 HSPBAP1Q96EW2 488 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 OR7D2Q96RA2 312 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 SPATA9Q9BWV2 254 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 LHPPQ9H008 270 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 NXF5Q9H1B4 397 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 OR51I1Q9H343 314 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 SPAG4Q9NPE6 437 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 ASF1BQ9NVP2 202 aa15.52■□□□□ 0.08
PACS1-208ENST00000529677 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa15.52■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 NME4O00746 187 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 CEACAM4O75871 244 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 NADKO95544 446 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 GUSBP08236 651 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 ALOX5P09917 674 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 ETFAP13804 333 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 RASSF2P50749 326 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 SLC7A2P52569 658 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 CORO7P57737 925 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 NCALDP61601 193 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 MXRA7P84157 204 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 TESK1Q15569 626 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 SPATS1Q496A3 300 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 TNFAIP8L2Q6P589 184 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 SLC5A8Q8N695 610 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 ADAMTS15Q8TE58 950 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 SLC35A4Q96G79 324 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 TRIM8Q9BZR9 551 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 ING2Q9H160 280 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 TMEM38AQ9H6F2 299 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 MYOTQ9UBF9 498 aa15.51■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 EXPH5Q8NEV8 1989 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 DNAJA2O60884 412 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 AK1P00568 194 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 CRATP43155 626 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 MLF1P58340 268 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 DSTNP60981 165 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 ADRM1Q16186 407 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 CYP27C1Q4G0S4 372 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 PIGGQ5H8A4 983 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 WDR53Q7Z5U6 358 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 DEFB107AQ8IZN7 70 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 ARHGAP24Q8N264 748 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 GALNT16Q8N428 558 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 SLC15A4Q8N697 577 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 OR5D16Q8NGK9 328 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 FAM110BQ8TC76 370 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 SLC9A6Q92581 669 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 ZNF583Q96ND8 569 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 GAL3ST4Q96RP7 486 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 BTBD10Q9BSF8 475 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 YIPF4Q9BSR8 244 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 BTBD2Q9BX70 525 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 LRMDAQ9H2I8 198 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 Q9N2J8 555 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 A4GALTQ9NPC4 353 aa15.5■□□□□ 0.07
PACS1-208ENST00000529677 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.6 ms