RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517049.1

RNU6-1271P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1271, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1271P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C9orf152Q5JTZ5 239 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TMEM252Q8N6L7 170 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SYT14Q8NB59 555 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POGLUT1Q8NBL1 392 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR2T33Q8NG76 320 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SPATA18Q8TC71 538 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RAET1EQ8TD07 263 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LRRC58Q96CX6 371 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR10C1Q96KK4 312 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CPXM1Q96SM3 734 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF559Q9BR84 538 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LMAN1LQ9HAT1 526 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NRN1Q9NPD7 142 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 GPR173Q9NS66 373 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PIGVQ9NUD9 493 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 WDR35Q9P2L0 1181 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRPC4Q9UBN4 977 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TBC1D29Q9UFV1 150 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PCDHGB4Q9UN71 923 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SEC16AO15027 2179 aa0.03□□□□□ -2.4
RNU6-1271P-201ENST00000517049 USP6P35125 1406 aa0.03□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM149AA5PLN7 773 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LAD1O00515 517 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RRP8O43159 456 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM189A1O60320 539 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ANP32DO95626 131 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CRISP2P16562 243 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CYP3A5P20815 502 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NTSP30990 170 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CRISP3P54108 245 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDKL1Q00532 357 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CDKN3Q16667 212 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RILPL1Q5EBL4 403 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RABGAP1LQ5R372 815 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATRAIDQ6UW56 229 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 C6orf120Q7Z4R8 191 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 UBALD2Q8IYN6 164 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FTMTQ8N4E7 242 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF740Q8NDX6 193 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR2A12Q8NGT7 310 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SETD6Q8TBK2 473 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PDXPQ96GD0 296 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FOXC2Q99958 501 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 IFI27L2Q9H2X8 130 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DCTPP1Q9H773 170 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR1A1Q9P1Q5 309 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RPS6KA6Q9UK32 745 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 L3MBTL1Q9Y468 752 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 BAHCC1Q9P281 2608 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ADGRL1O94910 1474 aa0.02□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF264O43296 627 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SDC1P18827 310 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 VDAC1P21796 283 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MAGEB1P43366 347 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CFAP221Q4G0U5 840 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CASC10Q5T4H9 136 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CST9LP1Q5W188 147 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM220AQ7Z4H9 259 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LINC00518Q8N0U6 118 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZNF461Q8TAF7 563 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HEXDCQ8WVB3 486 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM151AQ8WW52 585 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OR1E3Q8WZA6 343 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 RIT1Q92963 219 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 STACQ99469 402 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CARD6Q9BX69 1037 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ELOVL2Q9NXB9 296 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SYNJ2O15056 1496 aa0.01□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 E9PLD3 99 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MPZL1O95297 269 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EZRP15311 586 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PTENP60484 403 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 CUL4AQ13619 759 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 KCNJ11Q14654 390 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ALFQ53S48 1182 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 POMGNT2Q8NAT1 580 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 OCC1Q8TAD7 63 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 PSMG2Q969U7 264 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 DNAJA3Q96EY1 480 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 NRIP2Q9BQI9 281 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 MEPEQ9NQ76 525 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 EHFQ9NZC4 300 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 LIPGQ9Y5X9 500 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 FAM169AQ9Y6X4 670 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-1271P-201ENST00000517049 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms