RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514387.6

GPBP1-208, Transcript of GC-rich promoter binding protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene GPBP1, Length 3,310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPBP1-208ENST00000514387 FAM50BQ9Y247 325 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 SPIN1Q9Y657 262 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ANKRD12Q6UB98 2062 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 NAP1L6A6NFF2 107 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 KDM4EB2RXH2 506 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 TEX46H3BTG2 121 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 FFAR2O15552 330 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 RGS11O94810 467 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 UBXN7O94888 489 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 CPN1P15169 458 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 KCNE1P15382 129 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 DPEP1P16444 411 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 BTCP35070 178 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 CDKN2CP42773 168 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 PITPNBP48739 271 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 CDH12P55289 794 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 SMIM11AP58511 58 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 SKP1P63208 163 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 MBTPS1Q14703 1052 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 FAM69AQ5T7M9 428 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 SAMD7Q7Z3H4 446 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 DPPA2Q7Z7J5 298 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 MOSPD2Q8NHP6 518 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 TNFRSF14Q92956 283 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ORAI1Q96D31 301 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 SLC38A3Q99624 504 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ASB8Q9H765 288 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ACER3Q9NUN7 267 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 CLEC2DQ9UHP7 191 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ENPP4Q9Y6X5 453 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 LCTP09848 1927 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 SCN1AP35498 2009 aa8.33□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 SULT1C2O00338 296 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 IRAK2O43187 625 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 RP2O75695 350 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 GADD45GO95257 159 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 SLC10A3P09131 477 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 CBSLP0DN79 551 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 RHOQP17081 205 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 CBSP35520 551 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 RFC3P40938 356 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 SLC14A1Q13336 389 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ACER2Q5QJU3 275 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ZCCHC12Q6PEW1 402 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 OAFQ86UD1 273 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM86AQ8N2M4 240 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM130Q8N3G9 435 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ARRDC1Q8N5I2 433 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 OR2T35Q8NGX2 323 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 EEF1AKMT1Q8WVE0 214 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 BRI3BPQ8WY22 251 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 NKX6-2Q9C056 277 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 TPT1P8Q9HAU6 139 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 KCND3Q9UK17 655 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 C19orf53Q9UNZ5 99 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 RLFQ13129 1914 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ANKRD61A6NGH8 418 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 IQCF5A8MTL0 148 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM229AB2RXF0 380 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 OR1I1O60431 355 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 CLDN9O95484 217 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 FOLR2P14207 255 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 DRD2P14416 443 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 NPR2P20594 1047 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 CRATP43155 626 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 LHX1P48742 406 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 BDH1Q02338 343 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ITKQ08881 620 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 KRT33BQ14525 404 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 UBXN2BQ14CS0 331 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 CRB2Q5IJ48 1285 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 SLC35D3Q5M8T2 416 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 CDC73Q6P1J9 531 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 SLC27A1Q6PCB7 646 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 CD300LDQ6UXZ3 194 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 BHLHA9Q7RTU4 235 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 TRMT11Q7Z4G4 463 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 OR52I1Q8NGK6 324 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 IFT27Q9BW83 186 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 TMEM38AQ9H6F2 299 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 RLIMQ9NVW2 624 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 MED11Q9P086 117 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 EXO1Q9UQ84 846 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 SNX10Q9Y5X0 201 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 CTDSPLO15194 276 aa8.32□□□□□ -1.08
GPBP1-208ENST00000514387 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms