RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496246.5

TTLL3-231, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 507 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-231	ENST00000496246	PPP1R36	Q96LQ0	422 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	SFXN2	Q96NB2	322 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	NODAL	Q96S42	347 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	DUSP26	Q9BV47	211 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	BHLHE41	Q9C0J9	482 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	ACBD3	Q9H3P7	528 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	ANKRA2	Q9H9E1	313 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	THAP1	Q9NVV9	213 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM120C	Q9NX05	1096 aa	Known RBP	10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	TAS2R10	Q9NYW0	307 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	LIPG	Q9Y5X9	500 aa		10.36	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	DUXA	A6NLW8	204 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246		H0Y3Z8	333 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	SCD	O00767	359 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	SCO2	O43819	266 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	CELA3A	P09093	270 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	LBP	P18428	481 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	ENDOU	P21128	410 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	COL8A1	P27658	744 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	PTPN6	P29350	595 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	SOAT1	P35610	550 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	ANXA11	P50995	505 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	MAGOH	P61326	146 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	EEF1A1	P68104	462 aa	Known RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	PSG6	Q00889	435 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	C17orf67	Q0P5P2	114 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	GAB1	Q13480	694 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	PDE7A	Q13946	482 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	EEF1A1P5	Q5VTE0	462 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM219B	Q5XKK7	198 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	FGD2	Q7Z6J4	655 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	LACC1	Q8IV20	430 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	MISP	Q8IVT2	679 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM83F	Q8NEG4	500 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	GOT1L1	Q8NHS2	421 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	RMND5B	Q96G75	393 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	TTYH2	Q9BSA4	534 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	HOXD1	Q9GZZ0	328 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	GALNT9	Q9HCQ5	603 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	SERHL	Q9NQF3	203 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	RNF6	Q9Y252	685 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	10.35	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	DNAJC13	O75165	2243 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNHIT1	O43257	154 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	NDUFB5	O43674	189 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	WISP2	O76076	250 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	AGR2	O95994	175 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	DPP4	P27487	766 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	KIR3DL1	P43629	444 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	CCT3	P49368	545 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	CLDN8	P56748	225 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	NUP107	P57740	925 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	STX5	Q13190	355 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	CASP8	Q14790	479 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	PTGR1	Q14914	329 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	NHSL2	Q5HYW2	709 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	RAET1L	Q5VY80	246 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF787	Q6DD87	383 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	HDX	Q7Z353	690 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	P4HA3	Q7Z4N8	544 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	YRDC	Q86U90	279 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	ULK2	Q8IYT8	1036 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	MEIOB	Q8N635	442 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	TRIML2	Q8N7C3	387 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	SIMC1	Q8NDZ2	872 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	LILRB4	Q8NHJ6	448 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	SFXN5	Q8TD22	340 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	ARL8A	Q96BM9	186 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	STAC	Q99469	402 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	ACTRT3	Q9BYD9	372 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	NUF2	Q9BZD4	464 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	UBQLN3	Q9H347	655 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	MANSC1	Q9H8J5	431 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	PROK2	Q9HC23	129 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	TMBIM4	Q9HC24	238 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	ASIC5	Q9NY37	505 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	SPRR3	Q9UBC9	169 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	SLC6A5	Q9Y345	797 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	MRPS18C	Q9Y3D5	142 aa	Known RBP	10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	COL12A1	Q99715	3063 aa		10.34	□□□□□ -0.75
TTLL3-231	ENST00000496246	ZNF407	Q9C0G0	2248 aa		10.33	□□□□□ -0.76

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