RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462602.6

SH3BP4-208, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP4, Length 257 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-208ENST00000462602 IL33O95760 270 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 IFNA14P01570 189 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 HNRNPCL4P0DMR1 293 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ABCD3P28288 659 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 RFX3P48380 749 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SSR4P51571 173 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CCL11P51671 97 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PNLIPRP2P54317 469 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FOXK2Q01167 660 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 EFR3AQ14156 821 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SYPL1Q16563 259 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FXNQ16595 210 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ACER2Q5QJU3 275 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 AP1ARQ63HQ0 302 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PATL1Q86TB9 770 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 KRT73Q86Y46 540 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 HPS6Q86YV9 775 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM156Q8N614 296 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SIRT6Q8N6T7 355 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ANKFN1Q8N957 763 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 OR4N2Q8NGD1 307 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 OIT3Q8WWZ8 545 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ASB15Q8WXK1 588 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PSMF1Q92530 271 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 DIO2Q92813 273 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TMBIM1Q969X1 311 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ASB9Q96DX5 294 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 OMA1Q96E52 524 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TMEM19Q96HH6 336 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CLPTM1LQ96KA5 538 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 AGAP4Q96P64 663 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 RASL10BQ96S79 203 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF607Q96SK3 696 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM15Q9C019 465 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF350Q9GZX5 532 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 HOXD1Q9GZZ0 328 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 MTHFD2LQ9H903 347 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 LIN28AQ9H9Z2 209 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 BCL2L10Q9HD36 194 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 STMN3Q9NZ72 180 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PACSIN3Q9UKS6 424 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 WDR45Q9Y484 360 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 KCNMB2Q9Y691 235 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 AKAP13Q12802 2813 aa8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 OR6C70A6NIJ9 312 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 A6NL46 340 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TAF4O00268 1085 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CXCR6O00574 342 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TP53I11O14683 189 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TSPAN2O60636 221 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SERPINB7O75635 380 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PPM1BO75688 479 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PGM3O95394 542 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 NADKO95544 446 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ALPPP05187 535 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CHRM4P08173 479 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FBXO45P0C2W1 286 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ETS2P15036 469 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 NQO1P15559 274 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GGT1P19440 569 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ITPKBP27987 946 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SOX11P35716 441 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CASRP41180 1078 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CHRNEQ04844 493 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FUT5Q11128 374 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FLYWCH1Q4VC44 716 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CCNJQ5T5M9 372 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FCRLBQ6BAA4 426 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 GLYATQ6IB77 296 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ISLR2Q6UXK2 745 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC80Q76M96 950 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 NUP54Q7Z3B4 507 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PEX5LQ8IYB4 626 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 PRR22Q8IZ63 422 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF619Q8N2I2 560 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 AMER2Q8N7J2 671 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 ZNF527Q8NB42 609 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FAM156AQ8NDB6 213 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SPPL2AQ8TCT8 520 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 FIG4Q92562 907 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 TTC9Q92623 222 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-208ENST00000462602 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
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