RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 TM9SF1O15321 606 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC4A1P02730 911 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC35G4P0C7Q5 338 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRG2P13727 222 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 CPN1P15169 458 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 EFNA3P52797 238 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 DIO3P55073 304 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL9RQ01113 521 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 AP1B1Q10567 949 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 FUT7Q11130 342 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRR4Q16378 134 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL23RQ5VWK5 629 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 P4HA3Q7Z4N8 544 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 TAF8Q7Z7C8 310 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ART4Q93070 314 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 C16orf74Q96GX8 76 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 NMUR2Q9GZQ4 415 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABCG8Q9H221 673 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 SYTL2Q9HCH5 934 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADAM22Q9P0K1 906 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 GHRLQ9UBU3 117 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 IL20RAQ9UHF4 553 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 LRRK1Q38SD2 2015 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 USP6P35125 1406 aa1.74□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRIN2DO15399 1336 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 WI2-2373I1.2A0A1W2PRP0 233 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 TTC26A0AVF1 554 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 CFAP73A6NFT4 308 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 PANO1I0J062 215 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR7A17O14581 309 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALOX15BO15296 676 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZBTB14O43829 449 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAMP1O60894 148 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF254O75437 659 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 APBB3O95704 486 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 JCHAINP01591 159 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTPN6P29350 595 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRDX2P32119 198 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 HSPA1LP34931 641 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR3A4PP47883 348 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRPC1P48995 793 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUMBP49757 651 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPS8P62241 208 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 HERVK_113P63132 956 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERVK-8P63133 956 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPP2R5CQ13362 524 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBE2V2Q15819 145 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 CYP51A1Q16850 503 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLX4IPQ5VYV7 408 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR6B2Q6IFH4 312 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC39A4Q6P5W5 647 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 OLFM4Q6UX06 510 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 BTNL3Q6UXE8 466 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 STAC2Q6ZMT1 411 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM26Q6ZUK4 368 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 MOB1BQ7L9L4 216 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 CADM2Q8N3J6 435 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 CSNK1A1LQ8N752 337 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 OR2L5Q8NG80 312 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARNTL2Q8WYA1 636 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADIPOR1Q96A54 375 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC25A36Q96CQ1 311 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 LINC00167Q96N53 147 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERVK-6Q9BXR3 956 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 THAP9Q9H5L6 903 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASB8Q9H765 288 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 EHFQ9NZC4 300 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 BCAP29Q9UHQ4 241 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 PDE10AQ9Y233 779 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 NUDCQ9Y266 331 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 L3MBTL1Q9Y468 752 aa1.73□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHD4Q14839 1912 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARHGAP42A6NI28 874 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 E9PMD0 336 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 CCER2I3L3R5 266 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 SGK494L7N484 410 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 WWP2O00308 870 aa1.72□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 PPIHO43447 177 aaKnown RBP1.72□□□□□ -2.13
RNU6-227P-201ENST00000362865 STAM2O75886 525 aa1.72□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms