RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 RGMAQ96B86 450 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZHX1-C8orf76Q96EF9 292 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 HSPBAP1Q96EW2 488 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C7orf34Q96L11 122 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 Q96MT0 163 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 WDR92Q96MX6 357 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4K3Q96R72 315 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PIP5K1AQ99755 562 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 COPS4Q9BT78 406 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ITPAQ9BY32 194 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SPRY4Q9C004 299 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RHBGQ9H310 441 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FGF22Q9HCT0 170 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CLN6Q9NWW5 311 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ERVK-18Q9QC07 812 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MOSPD1Q9UJG1 213 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ADAM29Q9UKF5 820 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 UTS2RQ9UKP6 389 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ACSL5Q9ULC5 683 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 POLHQ9Y253 713 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ASF1AQ9Y294 204 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.6□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM202A6NGA9 273 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 B4E171 279 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KMOO15229 486 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PDPK1O15530 556 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 XPNPEP2O43895 674 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TNFRSF21O75509 655 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SERPINB7O75635 380 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 INMTO95050 263 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GADD45GO95257 159 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NADKO95544 446 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TGFB1P01137 390 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 KLK1P06870 262 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 HTR1AP08908 422 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DRD2P14416 443 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ACADLP28330 430 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TEAD1P28347 426 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PDHA2P29803 388 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP2R1BP30154 601 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DLSTP36957 453 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TSPAN7P41732 249 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 BMXP51813 675 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PGDP52209 483 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MAPK12P53778 367 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MANFP55145 182 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TAP2Q03519 686 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ITGADQ13349 1161 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SPDYE7PQ495Y7 208 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DEPDC1Q5TB30 811 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 BHLHB9Q6PI77 547 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF367Q7RTV3 350 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 LGI4Q8N135 537 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NAGSQ8N159 534 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 C10orf111Q8N326 155 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 RNF175Q8N4F7 328 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 AMER2Q8N7J2 671 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PLA2G15Q8NCC3 412 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4D9Q8NGE8 314 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NFKBIDQ8NI38 313 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NR4A3Q92570 626 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FKBP10Q96AY3 582 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MOAP1Q96BY2 351 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 YIPF6Q96EC8 236 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 NEURL3Q96EH8 262 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBED6CLQ96FA7 236 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM210AQ96ND0 272 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 DACH2Q96NX9 599 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 COL21A1Q96P44 957 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 APOOQ9BUR5 198 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FAIM2Q9BWQ8 316 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 MMP27Q9H306 513 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 ACOT13Q9NPJ3 140 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 VNN3Q9NY84 501 aa6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
SMARCE1-201ENST00000264640 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa6.59□□□□□ -1.35
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