RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261205.8

SYT1-201, Transcript of synaptotagmin 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYT1, Length 4,808 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1-201ENST00000261205 H0YIG0 161 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TUBA1BP68363 451 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 MICAQ29983 383 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 CGB2Q6NT52 195 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TMEM64Q6YI46 380 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TUBA1AQ71U36 451 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 IFI44Q8TCB0 444 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 CDS1Q92903 461 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 DIRAS2Q96HU8 199 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 NSA2O95478 260 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 SIGLEC14Q08ET2 396 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ZNF100Q8IYN0 542 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 FEVQ99581 238 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 LRRN3Q9H3W5 708 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 DIABLOQ9NR28 239 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ICKQ9UPZ9 632 aa14.92□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 CCDC182A6NF36 153 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 VTCN1Q7Z7D3 282 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 THAP4Q8WY91 577 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 PIK3R3Q92569 461 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TBX5Q99593 518 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 CD93Q9NPY3 652 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 A0A1W2PQ72 361 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 WBP2NLQ6ICG8 309 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 GPR137CQ8N3F9 429 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 PSMA8Q8TAA3 256 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 HSPBAP1Q96EW2 488 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 C11orf98E9PRG8 122 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ACTA2P62736 377 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ACTG2P63267 376 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 CYP27C1Q4G0S4 372 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 OGFRL1Q5TC84 451 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ACOT11Q8WXI4 607 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 NEURL3Q96EH8 262 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TAS2R10Q9NYW0 307 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TRPM7Q96QT4 1865 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 T-ENOLP0DO92 83 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 SLC9A3P48764 834 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TMEM215Q68D42 235 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 FAM83HQ6ZRV2 1179 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 UEVLDQ8IX04 471 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 POC5Q8NA72 575 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 SLC6A5Q9Y345 797 aa14.91□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 VILLO15195 856 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 S1PR1P21453 382 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TACR1P25103 407 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TRIM23P36406 574 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 KCNJ10P78508 379 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ATP1A4Q13733 1029 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 MROQ9BYG7 248 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 J3QLW9 94 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 SYT5O00445 386 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ZNF19P17023 458 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ZNF43P17038 809 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 RAB14P61106 215 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 C6orf141Q5SZD1 244 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ARL9Q6T311 187 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 CMIPQ8IY22 773 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 DOK4Q8TEW6 326 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TMEM239Q8WW34 195 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 NSMAFQ92636 917 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ADOQ96SZ5 270 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 TTYH2Q9BSA4 534 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 DOCK3Q8IZD9 2030 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 UBFD1O14562 309 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 AHCYL1O43865 530 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ZNF432O94892 652 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 CSF2P04141 144 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 GSTT2BP0CG30 244 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 PRKCAP17252 672 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 FAM53BQ14153 422 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 SFT2D3Q587I9 215 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 NRMQ8IXM6 262 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 GHDCQ8N2G8 530 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 OR6N2Q8NGY6 317 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 RSC1A1Q92681 617 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 COQ8BQ96D53 544 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 C20orf27Q9GZN8 174 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 ABCB10Q9NRK6 738 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 PCDH17O14917 1159 aa14.9□□□□□ -0.02
SYT1-201ENST00000261205 MOSPD3O75425 235 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.9 ms