RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560424.1

SMAD3-215, Transcript of SMAD family member 3, humanhuman

TSL 3

Gene SMAD3, Length 775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3-215ENST00000560424 NT5DC2Q9H857 520 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 PELI2Q9HAT8 420 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ZFP64Q9NPA5 681 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ADAP2Q9NPF8 381 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 SIRT5Q9NXA8 310 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 GALNT8Q9NY28 637 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF226Q9NYT6 803 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ARMCX1Q9P291 453 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ADGRE2Q9UHX3 823 aa8.51□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 LINC00032P0C843 101 aa8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa8.5□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 CCR8P51685 355 aa8.5□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 VEZF1Q14119 521 aa8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 DOC2AQ14183 400 aa8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 KIAA0040Q15053 153 aa8.5□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa8.5□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 C6orf136Q5SQH8 315 aa8.5□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 SLC22A10Q63ZE4 541 aa8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 POMZP3Q6PJE2 187 aa8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 NXPE4Q6UWF7 544 aa8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 HIPK1Q86Z02 1210 aa8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 FAM9CQ8IZT9 166 aa8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ZNF441Q8N8Z8 693 aa8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 OR4K1Q8NGD4 311 aa8.5□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 NEIL2Q969S2 332 aa8.5□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 FCRL1Q96LA6 429 aa8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ELOVL6Q9H5J4 265 aa8.5□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 HSD17B7P56937 341 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 STX1BP61266 288 aa8.49□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 TOMM20Q15388 145 aa8.49□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 KRT78Q8N1N4 520 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 CA13Q8N1Q1 262 aa8.49□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 SELENOMQ8WWX9 145 aa8.49□□□□□ -1.05
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SMAD3-215ENST00000560424 CMTM7Q96FZ5 175 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 TIMP4Q99727 224 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 BTBD10Q9BSF8 475 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 DOHHQ9BU89 302 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 MED18Q9BUE0 208 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 SFXN3Q9BWM7 321 aa8.49□□□□□ -1.05
SMAD3-215ENST00000560424 ACPTQ9BZG2 426 aa8.49□□□□□ -1.05
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