RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544777.1

KDM5A-211, Transcript of lysine demethylase 5A, humanhuman

TSL 2

Gene KDM5A, Length 670 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5A-211ENST00000544777 C3orf49Q96BT1 292 aa9.06□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 SIGLEC10Q96LC7 697 aa9.06□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM79Q9BSE2 394 aa9.06□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 PRR14Q9BWN1 585 aa9.06□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 DSN1Q9H410 356 aa9.06□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 PPP4R1LQ9P1A2 415 aa9.06□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 METRNQ9UJH8 293 aa9.06□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP9.06□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 ASB4Q9Y574 426 aa9.06□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 TMEM89A2RUT3 159 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 OR2M5A3KFT3 312 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 PGRMC2O15173 223 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 TAPBPO15533 448 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 STK16O75716 305 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 TUBBP07437 444 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 FAM58BPP0C7Q3 252 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 S1PR1P21453 382 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 DRD5P21918 477 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 KRT20P35900 424 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 GGT5P36269 586 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 PPICP45877 212 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 SLC6A8P48029 635 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 HSPA7P48741 367 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 PDLIM4P50479 330 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 XKP51811 444 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 EFNA4P52798 201 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 EFR3AQ14156 821 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 GANABQ14697 944 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 CRYMQ14894 314 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 TGFBIQ15582 683 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 TBCCQ15814 346 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 GALNT7Q86SF2 657 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 CNTN4Q8IWV2 1026 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 LAS2Q8IYD9 372 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 OR7G3Q8NG95 312 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 OR4K14Q8NGD5 310 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 OR5M1Q8NGP8 315 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 TMBIM1Q969X1 311 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 ESAMQ96AP7 390 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 ADOQ96SZ5 270 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 PIMREGQ9BSJ6 248 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 POTEKPQ9BYX7 375 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 BRINP2Q9C0B6 783 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 ZNF696Q9H7X3 374 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 STOML1Q9UBI4 398 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 TMEFF2Q9UIK5 374 aaPredicted RBP9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 AP4B1Q9Y6B7 739 aa9.05□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 A0A0A6YYD5 115 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 ESYT3A0FGR9 886 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 VWC2LB2RUY7 222 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 B4DXG7 233 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 FAM157AC9JC47 383 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 H7C417 338 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 ABCD4O14678 606 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 TO15178 435 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 TMPRSS11DO60235 418 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 SYNGR4O95473 234 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 BMP4P12644 408 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 CPMP14384 443 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 PORP16435 677 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 PGAM1P18669 254 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 NR4A2P43354 598 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 ARFIP1P53367 373 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 CPEB4Q17RY0 729 aaKnown RBP eCLIP9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 IQCCQ4KMZ1 466 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 MIDNQ504T8 468 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 SULT1C3Q6IMI6 304 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 FAM111BQ6SJ93 734 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 GABRG1Q8N1C3 465 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 MUC15Q8N387 334 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 RNF175Q8N4F7 328 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 FADS6Q8N9I5 356 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 OR2M3Q8NG83 312 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 SLC35A4Q96G79 324 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 RADILQ96JH8 1075 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 DHRS9Q9BPW9 319 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 PTGES2Q9H7Z7 377 aa9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
KDM5A-211ENST00000544777 MED11Q9P086 117 aa9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms