RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000526317.5

CSRP1-208, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CSRP1, Length 374 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1-208ENST00000526317 RFPL3SP0C7P2 107 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 CYP4B1P13584 511 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 ZNF24P17028 368 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 KRT20P35900 424 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 ZFP36L2P47974 494 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 PRIM2P49643 509 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 KCNJ2P63252 427 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 EFR3AQ14156 821 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 SLC10A1Q14973 349 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 DUSP5Q16690 384 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 DECR1Q16698 335 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 SPDYE7PQ495Y7 208 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 VPS26BQ4G0F5 336 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 CMPK2Q5EBM0 449 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 FNDC7Q5VTL7 733 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 MFSD12Q6NUT3 480 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 SLC30A6Q6NXT4 461 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 PAOXQ6QHF9 649 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 SZRD1Q7Z422 152 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 C6orf120Q7Z4R8 191 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 SLC22A16Q86VW1 577 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 ANKRD46Q86W74 232 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 CLEC4FQ8N1N0 589 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 TMEM251Q8N6I4 163 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 OR4A15Q8NGL6 344 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 PIK3R3Q92569 461 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 MOAP1Q96BY2 351 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 EFHD2Q96C19 240 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 RILPQ96NA2 401 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 MS4A4EQ96PG1 132 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 OR52E6Q96RD3 313 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 ZBTB18Q99592 522 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 DOHHQ9BU89 302 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 ACTRT3Q9BYD9 372 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 PIGUQ9H490 435 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 METTL7AQ9H8H3 244 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 ZFP64Q9NPA5 681 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 GPATCH2Q9NW75 528 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 ZIM2Q9NZV7 527 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 BTNL2Q9UIR0 455 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 OSGIN2Q9Y236 505 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 KCNE3Q9Y6H6 103 aa9.6□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 EXPH5Q8NEV8 1989 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 LRRC3CA6NJW4 275 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 TFECO14948 347 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 FADS1O60427 444 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 IL6P05231 212 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 MATN1P21941 496 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 UQCRC2P22695 453 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 IL12BP29460 328 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 MDH1P40925 334 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 MAGEA5P43359 124 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 MAN2A2P49641 1150 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 HSF1Q00613 529 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 GUCY1A3Q02108 690 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 SNTA1Q13424 505 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 TP53BP2Q13625 1128 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 CDC73Q6P1J9 531 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 PACS2Q86VP3 889 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 GHDCQ8N2G8 530 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 MIER2Q8N344 545 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 OR56A1Q8NGH5 318 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 OR5AK3PQ8NH89 298 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 FBXO30Q8TB52 745 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 SFXN5Q8TD22 340 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 RNF138Q8WVD3 245 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 TMEM41AQ96HV5 264 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 CCDC115Q96NT0 180 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 GNRHR2Q96P88 292 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 STACQ99469 402 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 INPP5KQ9BT40 448 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 NEUROD4Q9HD90 331 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 NPHS2Q9NP85 383 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 PLSCR2Q9NRY7 297 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 FBXO34Q9NWN3 711 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 GIN1Q9NXP7 522 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 FLRT3Q9NZU0 649 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 DCTN4Q9UJW0 460 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 ZNF835Q9Y2P0 537 aa9.59□□□□□ -0.87
CSRP1-208ENST00000526317 A0A1B0GTH9 108 aa9.58□□□□□ -0.88
CSRP1-208ENST00000526317 FAM234BA2RU67 622 aa9.58□□□□□ -0.88
CSRP1-208ENST00000526317 CLEC18AA5D8T8 446 aa9.58□□□□□ -0.88
CSRP1-208ENST00000526317 PRAMEF25A6NGN4 478 aa9.58□□□□□ -0.88
CSRP1-208ENST00000526317 CCDC154A6NI56 674 aa9.58□□□□□ -0.88
CSRP1-208ENST00000526317 ACOT7O00154 380 aa9.58□□□□□ -0.88
CSRP1-208ENST00000526317 ADAM10O14672 748 aa9.58□□□□□ -0.88
CSRP1-208ENST00000526317 GNB5O14775 395 aa9.58□□□□□ -0.88
CSRP1-208ENST00000526317 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP9.58□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms