RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524325.5

TSNARE1-208, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,963 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-208ENST00000524325 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 GPAT3Q53EU6 434 aa21■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 SAMD4BQ5PRF9 694 aaKnown RBP21■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 C16orf62Q7Z3J2 963 aa21■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 OR5M3Q8NGP4 307 aa21■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM19Q96HH6 336 aa21■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 RUBCNLQ9H714 662 aa21■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 Q9N2J8 555 aa21■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 DUSP22Q9NRW4 184 aa21■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 GIN1Q9NXP7 522 aa21■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 FRG2CA6NGY1 282 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 NPIPA7E9PJI5 369 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNK2O95069 426 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ALPPP05187 535 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 CHRM4P08173 479 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 NPIPA8P0DM63 369 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ULK2Q8IYT8 1036 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 BCORP1Q8N888 145 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 OR5L2Q8NGL0 311 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 NUBPLQ8TB37 319 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 STACQ99469 402 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 QRSL1Q9H0R6 528 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD10Q9NXR5 420 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 CBLCQ9ULV8 474 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ZZEF1O43149 2961 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 DUXAA6NLW8 204 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ITGA10O75578 1167 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 BMP2P12643 396 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ERFP50548 548 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 DCST2Q5T1A1 773 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 GALNT16Q8N428 558 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 OR8K3Q8NH51 312 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ZG16BQ96DA0 208 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 BTBD2Q9BX70 525 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 MKLN1Q9UL63 735 aa20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.99■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 H6PDO95479 791 aa20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 NADKO95544 446 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ABCD3P28288 659 aa20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 CDK6Q00534 326 aa20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 SCARB2Q14108 478 aa20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 VMACQ2NL98 169 aa20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ATAD3BQ5T9A4 648 aa20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 NET1Q7Z628 596 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 FBXW8Q8N3Y1 598 aa20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 SDF2Q99470 211 aa20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 FLRT3Q9NZU0 649 aa20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 P2RX2Q9UBL9 471 aa20.98■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ELOVL7A1L3X0 281 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 FAM220BPB1ANY3 271 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ASNA1O43681 348 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ARAFP10398 606 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 PIGAP37287 484 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 MS4A2Q01362 244 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 CHRNEQ04844 493 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 HEPHL1Q6MZM0 1159 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 MICU2Q8IYU8 434 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 FIG4Q92562 907 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 RASL10BQ96S79 203 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ADOQ96SZ5 270 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 LHPPQ9H008 270 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 A4GALTQ9NPC4 353 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 EXD2Q9NVH0 621 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 KCNMB2Q9Y691 235 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 PLCXD2Q0VAA5 305 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 PGM2L1Q6PCE3 622 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 LINC00696Q6ZRV3 163 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC5A8Q8N695 610 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 OMA1Q96E52 524 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 CRELD1Q96HD1 420 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 TMEM38AQ9H6F2 299 aa20.97■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 REM1O75628 298 aa20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ANXA11P50995 505 aaKnown RBP20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 RRADP55042 308 aa20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 MLF1P58340 268 aa20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 DCAF7P61962 342 aa20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 BROXQ5VW32 411 aa20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 TP53INP1Q96A56 240 aa20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 TREX2Q9BQ50 279 aaPredicted RBP20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 GPR83Q9NYM4 423 aa20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 SLC7A8Q9UHI5 535 aa20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 MED13Q9UHV7 2174 aa20.96■□□□□ 0.95
TSNARE1-208ENST00000524325 OR6B1O95007 311 aa20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.4 ms