RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 RPH3ALQ9UNE2 315 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 WDR45Q9Y484 360 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 KMT2EQ8IZD2 1858 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 PTPRTO14522 1441 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-162P-201ENST00000516228 RBFOX2O43251 390 aaKnown RBP eCLIP-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-162P-201ENST00000516228 CLN5O75503 358 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 SRP72O76094 671 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 SNAPINO95295 136 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-162P-201ENST00000516228 UCP1P25874 307 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 SNAPC1Q16533 368 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 LACTB2Q53H82 288 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 CMPK2Q5EBM0 449 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-162P-201ENST00000516228 ESX1Q8N693 406 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF740Q8NDX6 193 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF680Q8NEM1 530 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 C18orf25Q96B23 403 aaPredicted RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 TAAR1Q96RJ0 339 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 PKMYT1Q99640 499 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-162P-201ENST00000516228 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 CALHM2Q9HA72 323 aa-0.78□□□□□ -2.53
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RNU6-162P-201ENST00000516228 TMOD3Q9NYL9 352 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-162P-201ENST00000516228 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-162P-201ENST00000516228 C17orf82Q86X59 251 aaPredicted RBP-0.79□□□□□ -2.54
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RNU6-162P-201ENST00000516228 H0YL77 283 aa-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-162P-201ENST00000516228 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-162P-201ENST00000516228 GRAP2O75791 330 aa-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF688P0C7X2 276 aa-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-162P-201ENST00000516228 SSTR1P30872 391 aa-0.8□□□□□ -2.54
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RNU6-162P-201ENST00000516228 PITPNAQ00169 270 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDKL1Q00532 357 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-162P-201ENST00000516228 UBXN1Q04323 297 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-162P-201ENST00000516228 MORC3Q14149 939 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-162P-201ENST00000516228 PARP10Q53GL7 1025 aa-0.8□□□□□ -2.54
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